12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_0171 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_0171  hypothetical protein  100 
 
 
290 aa  602  1.0000000000000001e-171  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000544812  normal  0.222302 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4337  hypothetical protein  70.55 
 
 
290 aa  411  1e-114  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0230  hypothetical protein  43.01 
 
 
293 aa  209  6e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00664218  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0326  hypothetical protein  31.51 
 
 
293 aa  137  1e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0168823  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6272  hypothetical protein  24.57 
 
 
339 aa  91.7  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12748  hypothetical protein  25.13 
 
 
330 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000150126  normal  0.140472 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1572  hypothetical protein  31.54 
 
 
187 aa  54.3  0.000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.109182 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1159  hypothetical protein  27.59 
 
 
314 aa  52  0.00001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4727  hypothetical protein  21.77 
 
 
317 aa  49.7  0.00006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3722  hypothetical protein  26.01 
 
 
259 aa  48.9  0.00009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.866957  normal  0.716475 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4767  hypothetical protein  25.52 
 
 
317 aa  47.8  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.673464  normal  0.579441 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2194  hypothetical protein  21.39 
 
 
419 aa  47  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000275179 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>