30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_R0001 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012034  Athe_R0001  tRNA-Lys  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000136938  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0047  tRNA-Lys  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000815703  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0018  tRNA-Lys  93.15 
 
 		 76 bp  105  1e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0351719  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0039  tRNA-Lys  93.15 
 
 		 76 bp  105  1e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000395559  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0093  tRNA-Lys  91.89 
 
 		 76 bp  99.6  9e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  1.8722200000000002e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0051  tRNA-Lys  91.89 
 
 		 76 bp  99.6  9e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000111029  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0036  tRNA-Lys  91.89 
 
 		 76 bp  99.6  9e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000127196  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0008  tRNA-Lys  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00012117  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0061  tRNA-Lys  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000182131  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0080  tRNA-Lys  90.41 
 
 		 76 bp  89.7  9e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000242401  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0098  tRNA-Lys  90.41 
 
 		 76 bp  89.7  9e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000000573413  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0100  tRNA-Lys  90.41 
 
 		 76 bp  89.7  9e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000000556304  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0001  tRNA-Lys  90.41 
 
 		 76 bp  89.7  9e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000658326  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0022  tRNA-Lys  90.14 
 
 		 76 bp  85.7  0.000000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.786941  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0064  tRNA-Lys  89.04 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0329997  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0034  tRNA-Lys  89.04 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000195804  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0049  tRNA-Lys  86.84 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.0000000660852  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0082  tRNA-Lys  86.49 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000538289  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0067  tRNA-Lys  85.14 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0804329  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0029  tRNA-Lys  85.14 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000140728  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0026  tRNA-Lys  83.78 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000000388812  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0016  tRNA-Lys  83.78 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0352775  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0048  tRNA-Lys  83.78 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000002395  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0047  tRNA-Lys  83.78 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000112802  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0023  tRNA-Lys  83.78 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00169137  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0036  tRNA-Lys  83.78 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000293435  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0044  tRNA-Lys  89.47 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00224472  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0005  tRNA-Lys  89.47 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000194874  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0040  tRNA-Lys  84.48 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0026  tRNA-Val  89.47 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  unclonable  0.000000000373011  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>