18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_0862 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009718  Fnod_0508  type I restriction-modification system, M subunit  89.24 
 
 
2445 bp  2119    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2110  transposase  98.83 
 
 
1539 bp  2908    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.228237  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0076  transposase  98.44 
 
 
1539 bp  2861    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0786  transposase  98.44 
 
 
1539 bp  2861    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0816314  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0862    100 
 
 
4230 bp  8385    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.824616  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0863  transposase  100 
 
 
1539 bp  3051    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.330971  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1928  transposase  99.94 
 
 
1539 bp  3043    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00442004  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0683    82.7 
 
 
1508 bp  630  1e-178  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000360031  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2111    100 
 
 
611 bp  436  1e-119  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.46063  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0785  Resolvase domain protein  98.64 
 
 
609 bp  412  1.0000000000000001e-112  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00525149  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0075    100 
 
 
575 bp  402  1e-109  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.733226  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1929    100 
 
 
554 bp  402  1e-109  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00715836  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0682    85.93 
 
 
591 bp  165  1e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000417685  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1072  type I restriction-modification system, M subunit  79.59 
 
 
2448 bp  143  5e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1070  resolvase domain-containing protein  83.02 
 
 
594 bp  101  2e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.709621  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0025  IS605 family transposase OrfB  91.11 
 
 
1383 bp  58  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0400359  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0327  transposase, IS605 OrfB family  88.68 
 
 
1593 bp  58  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.00373732  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1448  transposase  86.79 
 
 
1593 bp  50.1  0.005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00728617  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>