15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_0997 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013171  Apre_0997  hypothetical protein  100 
 
 
171 aa  327  7e-89  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00610  signal transduction histidine kinase, LytS  40 
 
 
173 aa  94.4  7e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.926743  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1851  hypothetical protein  33.71 
 
 
178 aa  86.3  2e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl061  unknown transporter protein  32.28 
 
 
224 aa  73.9  0.000000000001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0163  hypothetical protein  35.33 
 
 
179 aa  66.6  0.0000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.648109  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2765  hypothetical protein  28.3 
 
 
187 aa  63.2  0.000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.657396  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1395  hypothetical protein  31.69 
 
 
174 aa  60.5  0.00000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.121181  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2465  hypothetical protein  33.09 
 
 
185 aa  60.1  0.00000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0452  hypothetical protein  32.65 
 
 
184 aa  60.1  0.00000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0776  hypothetical protein  35.71 
 
 
224 aa  57.4  0.00000009  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1884  hypothetical protein  35.71 
 
 
186 aa  55.5  0.0000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00603911  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0378  hypothetical protein  29.63 
 
 
180 aa  52  0.000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.337396  hitchhiker  0.000000691102 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf017  hypothetical protein  36.99 
 
 
335 aa  50.1  0.00001  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0612  hypothetical protein  28.1 
 
 
246 aa  42.4  0.003  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0687458  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0142  hypothetical protein  29.41 
 
 
185 aa  41.2  0.007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>