11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0045 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_0045  hypothetical protein  100 
 
 		 87 aa  171  2.9999999999999996e-42  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1923  integral membrane protein  77.91 
 
 		 92 aa  137  3.9999999999999997e-32  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.192633  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0839  small membrane protein  48.75 
 
 		 93 aa  84  6e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000265054  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0732  hypothetical protein  47.76 
 
 		 87 aa  74.7  0.0000000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2529  hypothetical protein  41.03 
 
 		 86 aa  73.2  0.000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0566491  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10250  hypothetical protein  41.03 
 
 		 85 aa  67  0.00000000008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.683516  normal  0.185712 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1328  small membrane protein  39.53 
 
 		 86 aa  66.2  0.0000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2193  hypothetical protein  40.7 
 
 		 85 aa  63.2  0.000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.247542  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0177  hypothetical protein  35.9 
 
 		 106 aa  61.6  0.000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1449  small membrane protein  42.25 
 
 		 104 aa  59.3  0.00000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000000657535  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4217  hypothetical protein  36.71 
 
 		 98 aa  56.2  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>