11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_0732 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_0732  hypothetical protein  100 
 
 		 87 aa  177  4.999999999999999e-44  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2529  hypothetical protein  70.59 
 
 		 86 aa  125  2.0000000000000002e-28  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0566491  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1328  small membrane protein  60.92 
 
 		 86 aa  112  2.0000000000000002e-24  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0177  hypothetical protein  55.17 
 
 		 106 aa  102  2e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10250  hypothetical protein  55.29 
 
 		 85 aa  101  3e-21  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.683516  normal  0.185712 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0839  small membrane protein  56.41 
 
 		 93 aa  95.1  3e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000265054  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2193  hypothetical protein  57.5 
 
 		 85 aa  94  7e-19  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.247542  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4217  hypothetical protein  50 
 
 		 98 aa  83.6  9e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1923  integral membrane protein  44.87 
 
 		 92 aa  78.2  0.00000000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.192633  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1449  small membrane protein  46.15 
 
 		 104 aa  77  0.00000000000007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000000657535  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0045  hypothetical protein  47.76 
 
 		 87 aa  74.7  0.0000000000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>