46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_6473 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_6473  protein of unknown function DUF86  100 
 
 		 92 aa  184  3e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2193  hypothetical protein  52.73 
 
 		 113 aa  107  7.000000000000001e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.242589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0548  hypothetical protein  29.06 
 
 		 114 aa  54.7  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.97195 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3038  protein of unknown function DUF86  33.33 
 
 		 114 aa  53.1  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1653  hypothetical protein  36 
 
 		 126 aa  51.6  0.000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.12899 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3689  hypothetical protein  33.33 
 
 		 114 aa  50.8  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.119376  hitchhiker  0.00953852 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1695  hypothetical protein  29.76 
 
 		 115 aa  50.8  0.000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.398533  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3906  protein of unknown function DUF86  32.1 
 
 		 113 aa  50.4  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5819  protein of unknown function DUF86  29.07 
 
 		 114 aa  48.9  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1037  protein of unknown function DUF86  34.25 
 
 		 110 aa  48.9  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0341749  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50240  hypothetical protein  36 
 
 		 131 aa  48.1  0.00004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.753692  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3118  hypothetical protein  34.67 
 
 		 112 aa  47.8  0.00005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2451  hypothetical protein  32.95 
 
 		 115 aa  47.8  0.00005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000252259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2463  hypothetical protein  37.14 
 
 		 78 aa  47.4  0.00006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.227725  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3032  hypothetical protein  40 
 
 		 118 aa  47.4  0.00007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.454999  normal  0.488274 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1341  protein of unknown function DUF86  36.11 
 
 		 127 aa  46.6  0.0001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1076  protein of unknown function DUF86  27.63 
 
 		 117 aa  45.1  0.0003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.814498  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0505  hypothetical protein  32 
 
 		 115 aa  45.1  0.0004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0868  protein of unknown function DUF86  32 
 
 		 115 aa  44.7  0.0004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0685  hypothetical protein  35.29 
 
 		 119 aa  45.1  0.0004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.923318  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1804  protein of unknown function DUF86  31.75 
 
 		 114 aa  44.3  0.0005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0997  protein of unknown function DUF86  35.53 
 
 		 115 aa  44.3  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0512778 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1805  protein of unknown function DUF86  32.56 
 
 		 108 aa  44.3  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.421633  normal  0.869871 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0370  hypothetical protein  32.91 
 
 		 114 aa  44.3  0.0006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.823692  normal  0.271446 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0899  hypothetical protein  27.38 
 
 		 116 aa  44.3  0.0006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.84236  unclonable  0.000014673 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0333  protein of unknown function DUF86  35.14 
 
 		 142 aa  43.9  0.0008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0373  hypothetical protein  27.85 
 
 		 116 aa  43.1  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.368479  normal  0.363257 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1765  protein of unknown function DUF86  30.12 
 
 		 113 aa  43.1  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.226627  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3537  hypothetical protein  34.88 
 
 		 119 aa  43.1  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.134567  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0549  hypothetical protein  35.38 
 
 		 112 aa  43.1  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1969  hypothetical protein  33.33 
 
 		 119 aa  43.1  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2758  hypothetical protein  28.92 
 
 		 118 aa  42.7  0.001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2533  hypothetical protein  34.78 
 
 		 116 aa  42.4  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0126172 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0089  hypothetical protein  31.4 
 
 		 115 aa  42  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0346134 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3558  hypothetical protein  25.61 
 
 		 117 aa  42  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.107769  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0275  hypothetical protein  30.26 
 
 		 110 aa  41.2  0.004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3298  protein of unknown function DUF86  33.77 
 
 		 117 aa  41.6  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000315403 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3145  protein of unknown function DUF86  32.89 
 
 		 113 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.94042 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1202  protein of unknown function DUF86  29.63 
 
 		 113 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1884  hypothetical protein  33.33 
 
 		 123 aa  41.2  0.005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.234797 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1293  protein of unknown function DUF86  35.62 
 
 		 114 aa  40.8  0.006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.053291  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0257  protein of unknown function DUF86  28.38 
 
 		 116 aa  40.8  0.006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1474  protein of unknown function DUF86  32.84 
 
 		 113 aa  40.8  0.006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.173165  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0358  hypothetical protein  32.43 
 
 		 112 aa  40.8  0.006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0316504 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3785  protein of unknown function DUF86  26.92 
 
 		 115 aa  40.8  0.007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.129087  normal  0.515713 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2287  hypothetical protein  32.43 
 
 		 111 aa  40.8  0.007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>