15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0903 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_0903  protein of unknown function DUF397  100 
 
 		 64 aa  130  6e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.558023  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6706  protein of unknown function DUF397  50.88 
 
 		 59 aa  53.1  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0228  hypothetical protein  52.73 
 
 		 80 aa  47.8  0.00006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.921134 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7003  protein of unknown function DUF397  41.56 
 
 		 84 aa  45.8  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4515  protein of unknown function DUF397  44.23 
 
 		 65 aa  44.7  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.545256 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1132  hypothetical protein  43.86 
 
 		 65 aa  43.5  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0037  hypothetical protein  46.67 
 
 		 69 aa  43.1  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1984  protein of unknown function DUF397  45.16 
 
 		 69 aa  43.1  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00383957  normal  0.845583 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24730  protein of unknown function (DUF397)  48.21 
 
 		 69 aa  43.5  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1161  protein of unknown function DUF397  50 
 
 		 62 aa  43.1  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.653899  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2071  hypothetical protein  49.02 
 
 		 67 aa  43.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.392038  normal  0.686099 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1162  protein of unknown function DUF397  45.9 
 
 		 62 aa  41.6  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.490498  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4454  protein of unknown function DUF397  44.64 
 
 		 69 aa  42  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1480  protein of unknown function DUF397  47.06 
 
 		 59 aa  40.8  0.006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5232  hypothetical protein  46.15 
 
 		 79 aa  40.4  0.007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.664195  normal  0.424507 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>