24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_1840 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_1840  ferredoxin  100 
 
 		 79 aa  158  2e-38  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0809  iron-sulfur cluster-binding protein  38.03 
 
 		 80 aa  55.8  0.0000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0339  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  38.67 
 
 		 134 aa  49.3  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.284381 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1505  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  39.44 
 
 		 134 aa  48.9  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.47907 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3341  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulphur binding, conserved site  48.28 
 
 		 134 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0398  iron-sulfur cluster-binding protein  28.17 
 
 		 80 aa  48.5  0.00003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.274807  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3200  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulphur binding, conserved site  38.03 
 
 		 134 aa  47.4  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.708883  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3612  NIL domain-containing protein  39.71 
 
 		 134 aa  46.2  0.0001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0684282  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22300  ABC transporter related  35.62 
 
 		 352 aa  46.6  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.321678  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0603  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  35.59 
 
 		 132 aa  46.6  0.0001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.145659  normal  0.822343 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2100  ABC transporter related  35.14 
 
 		 347 aa  46.2  0.0001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.182492  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1315  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  35.59 
 
 		 132 aa  45.8  0.0002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0220  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  33.9 
 
 		 132 aa  46.2  0.0002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.169897  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2288  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulphur binding, conserved site  35.21 
 
 		 134 aa  45.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2339  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  35.21 
 
 		 134 aa  45.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0168  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  30.88 
 
 		 141 aa  45.1  0.0004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.428069  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0733  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulphur binding, conserved site  33.33 
 
 		 137 aa  43.9  0.0007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1769  ABC transporter related  31.08 
 
 		 344 aa  43.1  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000333241  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0886  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  32 
 
 		 344 aa  43.1  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1720  ABC-type metal ion transport system, ATPase component  32.43 
 
 		 354 aa  43.5  0.001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0428  ABC-type metal ion transport system, ATPase component  37.5 
 
 		 359 aa  42.4  0.002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.982336  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3585  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  29.17 
 
 		 133 aa  41.6  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0774678  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0794  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  30.51 
 
 		 131 aa  40.4  0.009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.188784  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2838  hypothetical protein  28.79 
 
 		 215 aa  40  0.009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0694453  normal  0.21158 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>