28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_0045 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_0045    100 
 
 		 1047 bp  2076    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6080  taurine ABC transporter, periplasmic binding protein  79.43 
 
 		 1032 bp  135  3e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.147715 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2896  taurine ABC transporter, periplasmic binding protein  80.43 
 
 		 1017 bp  119  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.814597 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0419  taurine ABC transporter, periplasmic binding protein  96.77 
 
 		 1017 bp  107  6e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.402679 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2886  taurine ABC transporter, periplasmic binding protein  79.35 
 
 		 1017 bp  95.6  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2271  taurine ABC transporter, periplasmic binding protein  79.35 
 
 		 1017 bp  95.6  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6227  ABC taurine transporter, periplasmic ligand binding protein  81.42 
 
 		 1017 bp  93.7  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3846  taurine ABC transporter, periplasmic binding protein  88.37 
 
 		 1014 bp  91.7  4e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1765  taurine ABC transporter, periplasmic binding protein  92.98 
 
 		 1014 bp  81.8  0.0000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0087  ABC taurine transporter, periplasmic ligand binding protein  82.95 
 
 		 1023 bp  81.8  0.0000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.191531  normal  0.368778 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4209  ABC taurine transporter, periplasmic ligand binding protein  82.68 
 
 		 1023 bp  77.8  0.000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.494827 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1472  taurine ABC transporter, periplasmic binding protein  82.68 
 
 		 999 bp  77.8  0.000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0507  taurine ABC transporter, periplasmic binding protein  82.68 
 
 		 1023 bp  77.8  0.000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.058111 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4286  taurine ABC transporter, periplasmic binding protein  92.59 
 
 		 966 bp  75.8  0.00000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0766351  normal  0.912153 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2479  taurine ABC transporter, periplasmic binding protein  80.28 
 
 		 1065 bp  61.9  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.496729  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1504  extracellular solute-binding protein  88.14 
 
 		 1050 bp  61.9  0.0000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.190245  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2885  taurine ABC transporter, periplasmic binding protein  81.82 
 
 		 1065 bp  60  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0257  taurine ABC transporter, periplasmic binding protein  91.3 
 
 		 972 bp  60  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.953427  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4979  taurine ABC transporter, periplasmic binding protein  90.91 
 
 		 972 bp  56  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.213313  normal  0.468022 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0233  taurine ABC transporter, periplasmic binding protein  87.76 
 
 		 972 bp  50.1  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.786536  decreased coverage  0.000160369 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0248  taurine ABC transporter, periplasmic binding protein  87.76 
 
 		 972 bp  50.1  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0698542  normal  0.239622 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0598  phosphonate ABC transporter, periplasmic phosphonate-binding protein  96.43 
 
 		 1056 bp  48.1  0.005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00520789 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1028  hypothetical protein  100 
 
 		 276 bp  48.1  0.005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.04012 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0996  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  96.43 
 
 		 2490 bp  48.1  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.846195  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6342  aliphatic sulfonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  93.75 
 
 		 993 bp  48.1  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1089  taurine ABC transporter, taurine-binding protein  96.43 
 
 		 960 bp  48.1  0.005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2746  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase II  100 
 
 		 1242 bp  48.1  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1186  taurine ABC transporter, taurine-binding protein  96.43 
 
 		 960 bp  48.1  0.005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.217841  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>