65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_0403 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011206  Lferr_0567  hypothetical protein  100 
 
 		 105 aa  211  1.9999999999999998e-54  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0403  hypothetical protein  100 
 
 		 105 aa  211  1.9999999999999998e-54  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1338  hypothetical protein  35.16 
 
 		 104 aa  69.3  0.00000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.73825e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1534  hypothetical protein  37.36 
 
 		 104 aa  66.6  0.0000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1372  hypothetical protein  28.85 
 
 		 106 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0281  hypothetical protein  32.32 
 
 		 103 aa  62  0.000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1187  protein of unknown function DUF1255  32.97 
 
 		 103 aa  62  0.000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0389162 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3074  protein of unknown function DUF1255  32.97 
 
 		 103 aa  61.2  0.000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6412  hypothetical protein  25.96 
 
 		 106 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.725112 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6718  protein of unknown function DUF1255  25.96 
 
 		 106 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.042876  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1328  hypothetical protein  28.57 
 
 		 104 aa  59.3  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4431  hypothetical protein  25.96 
 
 		 106 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1707  hypothetical protein  25.51 
 
 		 103 aa  58.2  0.00000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.224011  hitchhiker  0.00197735 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1951  protein of unknown function DUF1255  30.77 
 
 		 104 aa  57.4  0.00000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.531149  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4838  hypothetical protein  26.92 
 
 		 104 aa  57.4  0.00000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1778  hypothetical protein  27.47 
 
 		 104 aa  56.6  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0253213  normal  0.0734741 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2901  hypothetical protein  25.51 
 
 		 103 aa  56.2  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.649398  normal  0.620309 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1300  hypothetical protein  25 
 
 		 106 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.441268  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2762  hypothetical protein  25.51 
 
 		 105 aa  55.5  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5759  hypothetical protein  25 
 
 		 106 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.233013  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3823  hypothetical protein  25 
 
 		 106 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4545  hypothetical protein  25 
 
 		 106 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.593261  normal  0.283548 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3372  hypothetical protein  28.57 
 
 		 104 aa  55.5  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4104  hypothetical protein  25 
 
 		 106 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2227  hypothetical protein  28.57 
 
 		 104 aa  55.5  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000123767  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0273  hypothetical protein  30.85 
 
 		 103 aa  54.7  0.0000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0269  protein of unknown function DUF1255  29.79 
 
 		 103 aa  54.7  0.0000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0265  hypothetical protein  30.85 
 
 		 103 aa  54.7  0.0000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1848  hypothetical protein  28.72 
 
 		 104 aa  54.7  0.0000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.711654 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2828  protein of unknown function DUF1255  27.17 
 
 		 105 aa  54.3  0.0000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.948708  normal  0.862924 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2422  protein of unknown function DUF1255  27.17 
 
 		 105 aa  54.3  0.0000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3969  hypothetical protein  24.04 
 
 		 106 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.539979  normal  0.0411996 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0273  hypothetical protein  29.79 
 
 		 103 aa  53.5  0.0000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1403  hypothetical protein  26.21 
 
 		 108 aa  52.8  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.148059  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0761  protein of unknown function DUF1255  26.37 
 
 		 104 aa  52  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.827861  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0379  hypothetical protein  30.85 
 
 		 103 aa  50.8  0.000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2102  hypothetical protein  30.77 
 
 		 103 aa  50.4  0.000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4775  hypothetical protein  24.24 
 
 		 105 aa  49.7  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0876813 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2688  hypothetical protein  26.14 
 
 		 105 aa  49.3  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2552  hypothetical protein  22.22 
 
 		 119 aa  48.9  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.271143  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1207  hypothetical protein  25.56 
 
 		 103 aa  48.1  0.00004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2672  protein of unknown function DUF1255  25 
 
 		 107 aa  47  0.00008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3765  protein of unknown function DUF1255  25.53 
 
 		 108 aa  47  0.00009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3029  hypothetical protein  23.33 
 
 		 103 aa  47  0.00009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.249045  normal  0.859497 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2232  protein of unknown function DUF1255  18.18 
 
 		 105 aa  46.2  0.0001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.470813  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2742  hypothetical protein  18.18 
 
 		 105 aa  46.2  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.156503  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4467  hypothetical protein  27.59 
 
 		 103 aa  46.6  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1083  hypothetical protein  20.83 
 
 		 108 aa  47  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0263  hypothetical protein  25.51 
 
 		 103 aa  46.6  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000961266 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1857  hypothetical protein  18.18 
 
 		 105 aa  45.4  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.637506  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3759  hypothetical protein  25.51 
 
 		 103 aa  45.8  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0262  hypothetical protein  25.51 
 
 		 103 aa  45.4  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000296906 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3112  hypothetical protein  30.77 
 
 		 94 aa  44.3  0.0006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0323  hypothetical protein  36.21 
 
 		 103 aa  43.9  0.0007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0338978  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0913  hypothetical protein  21.88 
 
 		 104 aa  43.1  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0064  hypothetical protein  24.27 
 
 		 111 aa  43.5  0.001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.268417  normal  0.539083 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1508  protein of unknown function DUF1255  24.73 
 
 		 103 aa  42.4  0.002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00328821  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1600  hypothetical protein  17.71 
 
 		 108 aa  42.7  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1472  hypothetical protein  33.33 
 
 		 103 aa  42.7  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0146  hypothetical protein  25.26 
 
 		 110 aa  42.4  0.002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2921  hypothetical protein  29.67 
 
 		 94 aa  41.6  0.004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.412619  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0998  hypothetical protein  26.09 
 
 		 94 aa  41.6  0.004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.239869  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0059  hypothetical protein  24.27 
 
 		 111 aa  41.6  0.004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3312  hypothetical protein  26.09 
 
 		 94 aa  41.6  0.004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1752  hypothetical protein  22.45 
 
 		 101 aa  40.4  0.008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0748694  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>