12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpp2118 on replicon NC_006368
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006368  lpp2118  hypothetical protein  100 
 
 		 287 aa  595  1e-169  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3394  hypothetical protein  42.42 
 
 		 258 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00000160878  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4096  hypothetical protein  49.54 
 
 		 349 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.934455 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6989  hypothetical protein  47 
 
 		 369 aa  94  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6269  hypothetical protein  44 
 
 		 365 aa  94  3e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.707187  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2433  hypothetical protein  35.64 
 
 		 558 aa  70.1  0.00000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3219  hypothetical protein  35.42 
 
 		 266 aa  65.1  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.242742  normal  0.443173 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3851  hypothetical protein  35.71 
 
 		 285 aa  60.8  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0385254  normal  0.135456 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2466  hypothetical protein  27.68 
 
 		 360 aa  46.6  0.0004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00527701  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3218  hypothetical protein  39.71 
 
 		 183 aa  47  0.0004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.450994  normal  0.420496 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1001  hypothetical protein  27.69 
 
 		 394 aa  46.2  0.0006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.428504  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2326  hypothetical protein  27.62 
 
 		 301 aa  45.1  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.16205  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>