24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpl1036 on replicon NC_006369
Organism: Legionella pneumophila str. Lens



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006369  lpl1036  hypothetical protein  100 
 
 		 66 aa  127  7.000000000000001e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1074  hypothetical protein  52.54 
 
 		 72 aa  67.4  0.00000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2378  hypothetical protein  51.92 
 
 		 65 aa  65.9  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0168  hypothetical protein  43.94 
 
 		 67 aa  58.5  0.00000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0150  hypothetical protein  43.75 
 
 		 67 aa  52.8  0.000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0829  carbon storage regulator, CsrA  38 
 
 		 99 aa  45.4  0.0002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.267846  normal  0.671396 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1043  carbon storage regulator  38.46 
 
 		 65 aa  45.1  0.0003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1844  carbon storage regulator  39.06 
 
 		 62 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0833226  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3554  carbon storage regulator  39.06 
 
 		 62 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00116705  normal  0.498706 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4273  carbon storage regulator  39.06 
 
 		 62 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000441223  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3977  carbon storage regulator  41.18 
 
 		 62 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1443  carbon storage regulator  41.18 
 
 		 62 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0139984  normal  0.7008 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3761  carbon storage regulator  41.18 
 
 		 62 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0455411  normal  0.413085 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4472  carbon storage regulator  41.18 
 
 		 62 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.219906  normal  0.197057 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3832  carbon storage regulator  45.1 
 
 		 65 aa  41.6  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3201  carbon storage regulator  45.1 
 
 		 65 aa  41.6  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.481754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1938  carbon storage regulator  45.1 
 
 		 65 aa  41.2  0.004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.219334  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3547  carbon storage regulator  45.1 
 
 		 65 aa  41.6  0.004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0375878 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0390  carbon storage regulator, CsrA  50.98 
 
 		 88 aa  41.2  0.005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1214  carbon storage regulator  36.51 
 
 		 65 aa  40.8  0.006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000424179  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02845  carbon storage regulator  33.33 
 
 		 63 aa  40.4  0.008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000287384  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0637  carbon storage regulator  37.5 
 
 		 66 aa  40.4  0.008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1301  carbon storage regulator  37.5 
 
 		 64 aa  40  0.009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000114714  normal  0.0123865 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3014  carbon storage regulator, CsrA  35.59 
 
 		 71 aa  40  0.01  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00086435  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>