23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_2816 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_2816  hypothetical protein  100 
 
 		 108 aa  222  1e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2904  ethyl tert-butyl ether degradation EthD  99.07 
 
 		 108 aa  221  4e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.507407  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2684  Ethyl tert-butyl ether degradation EthD  81.31 
 
 		 108 aa  190  5e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0370  hypothetical protein  35.71 
 
 		 113 aa  62.8  0.000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.978921  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1020  Ethyl tert-butyl ether degradation EthD  39.39 
 
 		 238 aa  59.3  0.00000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0532552  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3617  hypothetical protein  34.69 
 
 		 228 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.706123  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2874  Ethyl tert-butyl ether degradation EthD  36.36 
 
 		 253 aa  55.1  0.0000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2680  hypothetical protein  31.03 
 
 		 235 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.566186  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0353  Ethyl tert-butyl ether degradation EthD  35.51 
 
 		 233 aa  52.8  0.000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.429756  normal  0.260542 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5960  hypothetical protein  34 
 
 		 102 aa  48.1  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.546785 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3850  ethyl tert-butyl ether degradation EthD  30.39 
 
 		 230 aa  48.1  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.421261  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0350  Ethyl tert-butyl ether degradation EthD  31.58 
 
 		 231 aa  47.8  0.00005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00348812  normal  0.491483 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3492  Ethyl tert-butyl ether degradation EthD  32.43 
 
 		 111 aa  47.8  0.00006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5271  ethyl tert-butyl ether degradation EthD  32.5 
 
 		 113 aa  47  0.00009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.357656  hitchhiker  0.000208925 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2876  Ethyl tert-butyl ether degradation EthD  33.72 
 
 		 107 aa  47  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3830  hypothetical protein  31.31 
 
 		 104 aa  45.1  0.0003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.070961  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3523  ethyl tert-butyl ether degradation EthD  31.31 
 
 		 104 aa  45.1  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3831  Ethyl tert-butyl ether degradation EthD  29.87 
 
 		 113 aa  44.7  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.654041 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3811  hypothetical protein  33.71 
 
 		 123 aa  43.5  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00812123  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0362  Ethyl tert-butyl ether degradation EthD  32 
 
 		 255 aa  42  0.003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.620508 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2091  Ethyl tert-butyl ether degradation EthD  26.26 
 
 		 227 aa  42  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.844491  normal  0.246638 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4710  Ethyl tert-butyl ether degradation EthD  34.72 
 
 		 232 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7024  Ethyl tert-butyl ether degradation EthD  34.21 
 
 		 135 aa  40.4  0.009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.211246  normal  0.279453 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>