13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_2246 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_2246  hypothetical protein  100 
 
 		 154 aa  313  6e-85  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000552786  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1137  hypothetical protein  51.75 
 
 		 115 aa  113  7.999999999999999e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000105893  hitchhiker  3.11479e-26 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2251  hypothetical protein  44.44 
 
 		 158 aa  110  9e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000346124  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2809  hypothetical protein  26.32 
 
 		 141 aa  47  0.00009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.543438  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1509  hypothetical protein  28.71 
 
 		 141 aa  46.2  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.633162  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1258  hypothetical protein  28.42 
 
 		 141 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000158089  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1150  hypothetical protein  26.32 
 
 		 132 aa  45.1  0.0004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.59138  normal  0.272741 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1160  hypothetical protein  26.71 
 
 		 183 aa  44.3  0.0007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000194771  hitchhiker  8.03326e-20 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1423  hypothetical protein  26.71 
 
 		 183 aa  42.7  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000240373  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0692  hypothetical protein  33.33 
 
 		 140 aa  42  0.003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000916381  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2277  hypothetical protein  26 
 
 		 141 aa  42  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000286222  hitchhiker  0.0000000000000109213 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1432  hypothetical protein  25.74 
 
 		 141 aa  40.8  0.007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000253642  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2210  hypothetical protein  25.74 
 
 		 132 aa  40.8  0.007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000649524  hitchhiker  5.55598e-19 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>