27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_2020 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010465  YPK_2020  hypothetical protein  100 
 
 		 82 aa  170  6.999999999999999e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2240  hypothetical protein  100 
 
 		 82 aa  170  6.999999999999999e-42  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.575696  normal  0.0472844 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1909  hypothetical protein  100 
 
 		 82 aa  170  6.999999999999999e-42  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00135676  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02128  hypothetical protein  43.59 
 
 		 80 aa  79.3  0.00000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.555122  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4266  hypothetical protein  40.48 
 
 		 85 aa  69.7  0.00000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0504269  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05926  hypothetical protein  41.03 
 
 		 80 aa  66.6  0.0000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0710  hypothetical protein  40.26 
 
 		 83 aa  65.1  0.0000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.435603  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000196  hypothetical protein  35.9 
 
 		 80 aa  63.2  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000000484737  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3727  hypothetical protein  44.07 
 
 		 79 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1233  hypothetical protein  34.15 
 
 		 79 aa  57  0.00000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.9486  normal  0.0252217 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2851  hypothetical protein  29.33 
 
 		 87 aa  52.8  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2568  hypothetical protein  33.33 
 
 		 84 aa  52.4  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2829  hypothetical protein  30.77 
 
 		 81 aa  50.4  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.493287  normal  0.100972 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0325  hypothetical protein  33.33 
 
 		 86 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.629944 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2302  hypothetical protein  33.33 
 
 		 82 aa  47.8  0.00005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0311  hypothetical protein  30.26 
 
 		 86 aa  47  0.00009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.399436  decreased coverage  0.00561451 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0278  hypothetical protein  36.36 
 
 		 80 aa  46.6  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0596635  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5877  hypothetical protein  33.33 
 
 		 86 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0291  hypothetical protein  30.26 
 
 		 86 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0001659 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3173  hypothetical protein  32.2 
 
 		 79 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0316  hypothetical protein  27.63 
 
 		 86 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4895  hypothetical protein  28 
 
 		 92 aa  43.5  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67900  hypothetical protein  30.43 
 
 		 86 aa  42.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0525665  normal  0.0342115 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4917  hypothetical protein  28 
 
 		 86 aa  41.6  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.969012  hitchhiker  0.00139076 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4254  hypothetical protein  31.88 
 
 		 84 aa  41.6  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000233068 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1573  hypothetical protein  29.49 
 
 		 82 aa  40.8  0.007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.330992  normal  0.269924 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5336  hypothetical protein  26.67 
 
 		 86 aa  40.4  0.008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>