16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_0810 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_3686  putative phage integrase  100 
 
 		 322 aa  100  5e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0743  phage integrase family site specific recombinase  100 
 
 		 102 aa  100  6e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0810  putative phage integrase  100 
 
 		 49 aa  100  6e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0163  phage integrase family site specific recombinase  100 
 
 		 48 aa  98.2  3e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000123199 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0710  integrase family protein  72.92 
 
 		 324 aa  77.4  0.00000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4048  integrase family protein  53.66 
 
 		 343 aa  51.6  0.000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.900099 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4117  integrase family protein  60 
 
 		 337 aa  50.8  0.000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.944065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0401  integrase family protein  60 
 
 		 337 aa  50.8  0.000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.663201  normal  0.0314633 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4530  phage integrase family site specific recombinase  43.9 
 
 		 449 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4797  phage integrase  47.5 
 
 		 308 aa  45.4  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4434  phage integrase family site specific recombinase  43.59 
 
 		 427 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3356  phage integrase family protein  47.5 
 
 		 352 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36590  phage integrase  43.9 
 
 		 415 aa  44.7  0.0004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.706618  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51650  putative integrase  43.59 
 
 		 426 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000506916  hitchhiker  0.0000630791 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1421  Phage integrase  40 
 
 		 468 aa  42.7  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.602834  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4162  integrase family protein  55.56 
 
 		 396 aa  42.7  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>