14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xfasm12_1285 on replicon NC_010513
Organism: Xylella fastidiosa M12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010513  Xfasm12_1285  hypothetical protein  100 
 
 
381 aa  785    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1015  hypothetical protein  98.95 
 
 
381 aa  778    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.573023  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1252  hypothetical protein  98.95 
 
 
381 aa  778    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2410  putative bacteriophage protein  31.83 
 
 
393 aa  156  7e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1803  putative bacteriophage protein  33.44 
 
 
393 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1176  putative bacteriophage protein  31.35 
 
 
399 aa  143  6e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.118784  normal  0.0374243 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1242  hypothetical protein  27.42 
 
 
399 aa  130  5.0000000000000004e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0817  putative bacteriophage protein  30 
 
 
399 aa  129  9.000000000000001e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.816007 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2933  hypothetical protein  26.88 
 
 
399 aa  126  6e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3651  putative bacteriophage protein  27.94 
 
 
389 aa  124  2e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0414851  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2200  hypothetical protein  26.95 
 
 
399 aa  109  6e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.243728  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2245  putative bacteriophage protein  30.59 
 
 
396 aa  102  1e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.466176 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0855  hypothetical protein  27.08 
 
 
410 aa  95.1  2e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.253257  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2820  hypothetical protein  20.11 
 
 
394 aa  58.2  0.0000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>