8 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene XfasM23_1006 on replicon NC_010577
Organism: Xylella fastidiosa M23



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010577  XfasM23_1006  conjugal transfer protein  100 
 
 
118 aa  241  1.9999999999999999e-63  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2245  conjugal transfer protein  86.44 
 
 
120 aa  204  5e-52  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.342942  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1116  conjugal transfer protein  91.04 
 
 
80 aa  127  5.0000000000000004e-29  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.066169  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4320  conjugal transfer protein  45.87 
 
 
130 aa  79.3  0.00000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.663774  normal  0.434763 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6522  conjugal transfer protein  46.74 
 
 
129 aa  73.9  0.0000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.502553  n/a   
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6615  conjugal transfer protein  46.74 
 
 
129 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.184542  n/a   
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0022  putative conjugal transfer protein TraD  46.38 
 
 
77 aa  55.5  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4667  conjugal transfer protein  50 
 
 
59 aa  46.2  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>