12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_1962 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_1962  hypothetical protein  100 
 
 
199 aa  394  1e-109  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.134742  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0973  hypothetical protein  34.16 
 
 
198 aa  73.2  0.000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4340  hypothetical protein  31.29 
 
 
201 aa  68.9  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.142326  normal  0.0705595 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3034  hypothetical protein  35 
 
 
199 aa  60.5  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00100979 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1501  hypothetical protein  27.7 
 
 
437 aa  50.1  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3814  hypothetical protein  26.51 
 
 
423 aa  47.8  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1500  hypothetical protein  27.23 
 
 
202 aa  47  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1820  hypothetical protein  29.65 
 
 
409 aa  44.7  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.448323  normal  0.25103 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1884  hypothetical protein  26.46 
 
 
198 aa  44.3  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.144488  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1132  hypothetical protein  31.11 
 
 
344 aa  42.4  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0828  hypothetical protein  29.25 
 
 
439 aa  42  0.006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.734723  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1823  hypothetical protein  25.79 
 
 
426 aa  42  0.006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>