13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_4978 on replicon NC_009717
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009717  Xaut_4978  hypothetical protein  100 
 
 
292 aa  593  1e-169  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0274  hypothetical protein  72.89 
 
 
288 aa  414  1e-114  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4661  hypothetical protein  73.96 
 
 
289 aa  409  1e-113  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.782709  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4319  hypothetical protein  70.4 
 
 
294 aa  396  1e-109  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.646386  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4479  hypothetical protein  63.1 
 
 
290 aa  371  1e-102  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0874335  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8095  hypothetical protein  63.92 
 
 
295 aa  374  1e-102  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9167  hypothetical protein  59.25 
 
 
296 aa  345  6e-94  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4753  hypothetical protein  57.66 
 
 
296 aa  310  2e-83  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0378  hypothetical protein  50.19 
 
 
276 aa  242  5e-63  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7036  hypothetical protein  50 
 
 
220 aa  202  4e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2690  hypothetical protein  32.17 
 
 
332 aa  70.1  0.00000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000167925  normal  0.0455749 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3175  hypothetical protein  28.64 
 
 
252 aa  58.5  0.0000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4216  hypothetical protein  30.77 
 
 
324 aa  45.8  0.0009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>