19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_4099 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_4099  hypothetical protein  100 
 
 
189 aa  387  1e-107  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6498  hypothetical protein  56.76 
 
 
201 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.760399  normal  0.0435386 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3074  protein of unknown function DUF447  58.15 
 
 
193 aa  209  1e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1580  hypothetical protein  54.05 
 
 
191 aa  200  8e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000289305  unclonable  0.000000163733 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2455  hypothetical protein  55.03 
 
 
199 aa  199  9.999999999999999e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.11758  normal  0.238821 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2393  protein of unknown function DUF447  55.93 
 
 
185 aa  193  2e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3142  hypothetical protein  53.8 
 
 
195 aa  189  2e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1244  hypothetical protein  59.6 
 
 
176 aa  188  5e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5940  hypothetical protein  54.79 
 
 
197 aa  188  5e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00846558 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1841  hypothetical protein  50 
 
 
198 aa  181  7e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2176  protein of unknown function DUF447  49.46 
 
 
198 aa  178  4e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.178161  normal  0.504113 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1792  hypothetical protein  48.4 
 
 
198 aa  176  2e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.393771  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2617  hypothetical protein  50.79 
 
 
196 aa  176  2e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0409017  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2726  hypothetical protein  50.28 
 
 
196 aa  172  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.129354 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5322  protein of unknown function DUF447  50.56 
 
 
199 aa  170  9e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.193969  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5018  hypothetical protein  51.67 
 
 
198 aa  170  1e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00575685 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2424  protein of unknown function DUF447  29.8 
 
 
201 aa  72.4  0.000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0904426  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2337  protein of unknown function DUF447  28.11 
 
 
215 aa  43.9  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0425454  normal  0.12878 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0768  hypothetical protein  25.68 
 
 
193 aa  42.7  0.003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>