22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_6316 on replicon NC_012792
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012792  Vapar_6316  hypothetical protein  100 
 
 		 198 aa  367  1e-101  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.843909  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0084  hypothetical protein  75.65 
 
 		 195 aa  272  2.0000000000000002e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.898737  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5040  hypothetical protein  40.7 
 
 		 221 aa  99.4  3e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4188  hypothetical protein  45.05 
 
 		 203 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7221  hypothetical protein  43.11 
 
 		 199 aa  82.4  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.288323 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2983  hypothetical protein  39.75 
 
 		 210 aa  75.9  0.0000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000560028  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2174  transmembrane protein  37.65 
 
 		 225 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2094  conserved transmembrane protein  36.84 
 
 		 226 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0337  hypothetical protein  42.33 
 
 		 211 aa  72.4  0.000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0089  hypothetical protein  42.18 
 
 		 225 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.081156  normal  0.324813 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5905  hypothetical protein  38.6 
 
 		 221 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.812224 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1020  hypothetical protein  38.46 
 
 		 200 aa  63.2  0.000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.113619  normal  0.37406 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2870  hypothetical protein  39.58 
 
 		 222 aa  62.8  0.000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.922239  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1963  hypothetical protein  40.6 
 
 		 221 aa  61.2  0.000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.957184  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2574  hypothetical protein  40.6 
 
 		 221 aa  61.2  0.000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2598  hypothetical protein  40.6 
 
 		 221 aa  61.2  0.000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0756  hypothetical protein  34.1 
 
 		 219 aa  60.8  0.00000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.144399  normal  0.406336 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0723  hypothetical protein  40.6 
 
 		 225 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.174182 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2493  hypothetical protein  40.6 
 
 		 221 aa  54.3  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.236869  normal  0.998378 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2622  hypothetical protein  39.85 
 
 		 221 aa  53.1  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1370  hypothetical protein  34.5 
 
 		 232 aa  48.9  0.00005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.73391  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1418  Gram-positive anchor  41.86 
 
 		 262 aa  48.5  0.00006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.248411  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>