20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_5126 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_5126  hypothetical protein  100 
 
 		 104 aa  208  2e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0730  hypothetical protein  89 
 
 		 115 aa  179  1e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3636  hypothetical protein  77 
 
 		 121 aa  154  5.0000000000000005e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.678182  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3959  hypothetical protein  77.55 
 
 		 117 aa  154  5.0000000000000005e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.281179  normal  0.0264743 
 
 
-
 
NC_003296  RS02124  hypothetical protein  77.23 
 
 		 112 aa  141  4e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2264  conserved hypothetical conserved membrane protein  71.43 
 
 		 123 aa  140  5e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.153108  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7358  small integral membrane protein  73.53 
 
 		 113 aa  137  3.9999999999999997e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.585569 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2429  hypothetical protein  67.01 
 
 		 118 aa  137  3.9999999999999997e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5940  small integral membrane protein  76.7 
 
 		 113 aa  134  4e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6213  small integral membrane protein  76.7 
 
 		 113 aa  134  4e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2478  hypothetical protein  67 
 
 		 124 aa  133  7.000000000000001e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4876  hypothetical protein  73.27 
 
 		 115 aa  130  5e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0975253 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3799  hypothetical protein  73.27 
 
 		 115 aa  130  5e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2590  conserved hypothetical conserved membrane protein  71.72 
 
 		 121 aa  130  6.999999999999999e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.585354  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3894  cytochrome c oxidase subunit IV  59.41 
 
 		 109 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.798918  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2362  cytochrome c oxidase subunit IV  65.26 
 
 		 110 aa  127  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0250  hypothetical protein  72 
 
 		 128 aa  124  6e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00978693 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2341  cytochrome c oxidase, subunit IV  51.92 
 
 		 114 aa  75.5  0.0000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5676  hypothetical protein  33.72 
 
 		 107 aa  43.9  0.0007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.967687 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3465  hypothetical protein  26.32 
 
 		 111 aa  41.2  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0320908 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>