11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_3298 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_3298  hypothetical protein  100 
 
 		 202 aa  398  9.999999999999999e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.678819  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2682  hypothetical protein  51.16 
 
 		 173 aa  151  5.9999999999999996e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.516473  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5202  hypothetical protein  41.24 
 
 		 199 aa  94.4  1e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1254  hypothetical protein  42.19 
 
 		 192 aa  77.4  0.0000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0784448  hitchhiker  0.00558378 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4083  hypothetical protein  29.44 
 
 		 179 aa  50.1  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4195  hypothetical protein  29.44 
 
 		 179 aa  50.1  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1337  putative proline-rich protein  35.11 
 
 		 171 aa  46.6  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.254173 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3737  hypothetical protein  31.33 
 
 		 179 aa  47  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2393  hypothetical protein  32.97 
 
 		 175 aa  46.2  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1455  hypothetical protein  37.68 
 
 		 184 aa  42.7  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.936799 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2605  hypothetical protein  30.53 
 
 		 164 aa  43.1  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>