14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_1522 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_1522  Flp/Fap pilin component  100 
 
 		 58 aa  117  6e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1521  hypothetical protein  83.64 
 
 		 69 aa  94.4  5e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1523  hypothetical protein  47.37 
 
 		 58 aa  56.6  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4197  Flp/Fap pilin component  47.92 
 
 		 54 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.692127  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0223  component of type 4 pilus pilin subunit protein  42.11 
 
 		 61 aa  45.8  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.668081  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4185  Flp/Fap pilin component  62.07 
 
 		 61 aa  43.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1406  Flp/Fap pilin component  57.5 
 
 		 54 aa  42  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0222  component of type 4 pilus pilin subunit protein  58.06 
 
 		 61 aa  42.7  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4473  Flp/Fap pilin component  62.07 
 
 		 62 aa  42.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.837061  normal  0.806364 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2363  Flp/Fap pilin component  46 
 
 		 60 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.780367 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0974  Flp/Fap pilin component  45.83 
 
 		 56 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.179102  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2824  Flp/Fap pilin component  37.04 
 
 		 56 aa  40.8  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.50451  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4095  Flp/Fap pilin component  43.4 
 
 		 60 aa  40.8  0.006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7028  putative Flp/Fap pilin component  58.06 
 
 		 54 aa  40  0.01  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.779148  normal  0.931089 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>