25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_0602 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_0602  phage-type endonuclease  100 
 
 		 247 aa  499  1e-140  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1657  hypothetical protein  48.39 
 
 		 342 aa  188  7e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2448  hypothetical protein  46.41 
 
 		 342 aa  188  8e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2495  hypothetical protein  47.89 
 
 		 334 aa  187  2e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1183  Phage-related protein endonuclease-like protein  46.98 
 
 		 334 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4743  phage-related protein endonuclease-like protein  43.86 
 
 		 334 aa  175  6e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.231327  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2726  hypothetical protein  44.65 
 
 		 331 aa  169  4e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.302744  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3684  hypothetical protein  48.95 
 
 		 300 aa  166  2e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.429616  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0204  GP47  44.55 
 
 		 331 aa  163  3e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0110  hypothetical protein  44.13 
 
 		 358 aa  159  4e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0866  hypothetical protein  40.53 
 
 		 374 aa  143  3e-33  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.896574  normal  0.759302 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1620  hypothetical protein  40 
 
 		 374 aa  142  6e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.56685  normal  0.026153 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2356  hypothetical protein  39.9 
 
 		 368 aa  136  4e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0622812  normal  0.0723481 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1473  Phage-related protein endonuclease-like protein  35.47 
 
 		 306 aa  119  3.9999999999999996e-26  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2619  YqaJ  33.33 
 
 		 311 aa  107  1e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000010002  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0602  phage-type endonuclease  33.18 
 
 		 311 aa  107  2e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2263  hypothetical protein  30.43 
 
 		 310 aa  102  7e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00963472  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0938  hypothetical protein  31.47 
 
 		 303 aa  100  2e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3414  Phage-related protein endonuclease-like protein  32.14 
 
 		 303 aa  82.8  0.000000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0329559 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0982  hypothetical protein  25.37 
 
 		 338 aa  77  0.0000000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000285055  hitchhiker  0.0000282178 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3739  putative phage-related protein  28.78 
 
 		 322 aa  76.3  0.0000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00326083  normal  0.30406 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1345  Phage-related protein endonuclease-like protein  25.11 
 
 		 338 aa  75.1  0.000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000000265319  decreased coverage  0.000101887 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0373  Phage-related protein endonuclease-like protein  42.86 
 
 		 136 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.743719 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1286  hypothetical protein  31.31 
 
 		 304 aa  47.4  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2700  Phage-related protein endonuclease-like  24.74 
 
 		 303 aa  43.1  0.004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>