10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_p840_09 on replicon NC_011311
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011311  VSAL_p840_09  conjugative transfer protein TrbI  100 
 
 		 115 aa  232  1.0000000000000001e-60  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0028  conjugal transfer protein TrbI  34.58 
 
 		 128 aa  60.1  0.00000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4291  hypothetical protein  29.27 
 
 		 138 aa  46.6  0.0001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.697334  normal  1 
 
 
-
 
NC_006366  plpl0021  hypothetical protein  33.82 
 
 		 111 aa  43.1  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4441  pilus assembly protein  30.11 
 
 		 123 aa  41.6  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4534  pilus assembly protein  30.11 
 
 		 123 aa  42  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.783095 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4379  conjugal transfer protein TrbI  30.11 
 
 		 123 aa  42  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4437  conjugal transfer protein TrbI  30.11 
 
 		 123 aa  42  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.391432  normal  1 
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4503  conjugal transfer protein TrbI  28.71 
 
 		 123 aa  40.4  0.007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0029  hypothetical protein  31.91 
 
 		 111 aa  40  0.01  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>