10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_4503 on replicon NC_011665
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011665  Sbal223_4503  conjugal transfer protein TrbI  100 
 
 		 123 aa  246  8e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4441  pilus assembly protein  91.06 
 
 		 123 aa  208  2e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4534  pilus assembly protein  90.24 
 
 		 123 aa  206  1e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.783095 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4379  conjugal transfer protein TrbI  90.24 
 
 		 123 aa  206  1e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4437  conjugal transfer protein TrbI  89.43 
 
 		 123 aa  204  3e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.391432  normal  1 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4626  hypothetical protein  92.45 
 
 		 106 aa  180  7e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.893859 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0028  conjugal transfer protein TrbI  32.08 
 
 		 128 aa  63.9  0.0000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_09  conjugative transfer protein TrbI  28.71 
 
 		 115 aa  57.4  0.00000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4291  hypothetical protein  32.93 
 
 		 138 aa  43.5  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.697334  normal  1 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4228  sex-pilus assembly protein  30.39 
 
 		 119 aa  41.2  0.004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>