295 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I3096r on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011312  VSAL_I3096r  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 121 bp  240  6.999999999999999e-62  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3186r  5S ribosomal RNA  97.35 
 
 		 120 bp  200  6e-50  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.713865  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3210r  5S ribosomal RNA  97.35 
 
 		 121 bp  200  6e-50  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3109r  5S ribosomal RNA  97.35 
 
 		 120 bp  200  6e-50  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0264558  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3182r  5S ribosomal RNA  97.35 
 
 		 120 bp  200  6e-50  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.175468  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3084r  5S ribosomal RNA  97.35 
 
 		 120 bp  200  6e-50  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.00000384102  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3073r  5S ribosomal RNA  97.35 
 
 		 120 bp  200  6e-50  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.00000752328  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3091r  5S ribosomal RNA  97.35 
 
 		 120 bp  200  6e-50  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.211097  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3094r  5S ribosomal RNA  97.35 
 
 		 120 bp  200  6e-50  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3114r  5S ribosomal RNA  97.35 
 
 		 120 bp  200  6e-50  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3139r  5S ribosomal RNA  97.35 
 
 		 120 bp  200  6e-50  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.604121  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3078r  5S ribosomal RNA  96.46 
 
 		 120 bp  192  1e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.00000647094  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1115r  5S ribosomal RNA  96.46 
 
 		 120 bp  192  1e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.155986  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna091  5S ribosomal RNA  94.74 
 
 		 121 bp  170  5e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.010484  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna060  5S ribosomal RNA  93.86 
 
 		 121 bp  163  1e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna054  5S ribosomal RNA  93.86 
 
 		 121 bp  163  1e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000122961  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2334  5S ribosomal RNA  92.98 
 
 		 124 bp  163  1e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000925408  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna023  5S ribosomal RNA  93.86 
 
 		 121 bp  163  1e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna077  5S ribosomal RNA  93.86 
 
 		 121 bp  163  1e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000940353  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna035  5S ribosomal RNA  93.86 
 
 		 121 bp  163  1e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna046  5S ribosomal RNA  93.86 
 
 		 121 bp  163  1e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna082  5S ribosomal RNA  93.86 
 
 		 121 bp  163  1e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna042  5S ribosomal RNA  93.86 
 
 		 121 bp  163  1e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_rna010  5S ribosomal RNA  93.86 
 
 		 121 bp  163  1e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna089  5S ribosomal RNA  93.86 
 
 		 121 bp  163  1e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.011168  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna154  5S ribosomal RNA  93.86 
 
 		 121 bp  163  1e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2071  5S ribosomal RNA  92.92 
 
 		 124 bp  161  5e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2456  5S ribosomal RNA  92.92 
 
 		 124 bp  161  5e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2325  5S ribosomal RNA  92.92 
 
 		 123 bp  161  5e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0246  5S ribosomal RNA  92.92 
 
 		 121 bp  161  5e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.25142  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0128  5S ribosomal RNA  95.05 
 
 		 121 bp  161  5e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_r003  5S ribosomal RNA  95.05 
 
 		 120 bp  161  5e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_r006  5S ribosomal RNA  95.05 
 
 		 120 bp  161  5e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_r009  5S ribosomal RNA  95.05 
 
 		 120 bp  161  5e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_r010  5S ribosomal RNA  95.05 
 
 		 120 bp  161  5e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_r013  5S ribosomal RNA  95.05 
 
 		 120 bp  161  5e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_r016  5S ribosomal RNA  95.05 
 
 		 120 bp  161  5e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_r019  5S ribosomal RNA  95.05 
 
 		 120 bp  161  5e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_r022  5S ribosomal RNA  95.05 
 
 		 120 bp  161  5e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_r025  5S ribosomal RNA  95.05 
 
 		 120 bp  161  5e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0003  5S ribosomal RNA  95.05 
 
 		 116 bp  161  5e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.530292  hitchhiker  0.00148458 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0011  5S ribosomal RNA  95.05 
 
 		 116 bp  161  5e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0219912  normal  0.295401 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0018  5S ribosomal RNA  95.05 
 
 		 116 bp  161  5e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000474552 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0075  5S ribosomal RNA  95.05 
 
 		 116 bp  161  5e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0121  5S ribosomal RNA  95.05 
 
 		 116 bp  161  5e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.777724 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0130  5S ribosomal RNA  95.05 
 
 		 116 bp  161  5e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.799591 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0134  5S ribosomal RNA  95.05 
 
 		 116 bp  161  5e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00025818  hitchhiker  0.00693749 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0138  5S ribosomal RNA  95.05 
 
 		 116 bp  161  5e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0141  5S ribosomal RNA  95.05 
 
 		 116 bp  161  5e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.232232 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0395  hypothetical protein  95.05 
 
 		 129 bp  161  5e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000730757  normal  0.0497188 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0003  5S ribosomal RNA  95.05 
 
 		 116 bp  161  5e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.377147  hitchhiker  0.00225756 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0011  5S ribosomal RNA  95.05 
 
 		 116 bp  161  5e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00932419 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0018  5S ribosomal RNA  95.05 
 
 		 116 bp  161  5e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.374169 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0024  5S ribosomal RNA  95.05 
 
 		 116 bp  161  5e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000358593  normal  0.0497188 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0028  5S ribosomal RNA  95.05 
 
 		 116 bp  161  5e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.966911 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0075  5S ribosomal RNA  95.05 
 
 		 116 bp  161  5e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.110925 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0121  5S ribosomal RNA  95.05 
 
 		 116 bp  161  5e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.676383 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0139  5S ribosomal RNA  95.05 
 
 		 116 bp  161  5e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0142  5S ribosomal RNA  95.05 
 
 		 116 bp  161  5e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0003  5S ribosomal RNA  95.05 
 
 		 120 bp  161  5e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.95198  hitchhiker  0.000000732867 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0018  5S ribosomal RNA  95.05 
 
 		 120 bp  161  5e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000011379 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0073  5S ribosomal RNA  95.05 
 
 		 120 bp  161  5e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.568148  normal  0.279617 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0118  5S ribosomal RNA  95.05 
 
 		 120 bp  161  5e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0128  5S ribosomal RNA  95.05 
 
 		 120 bp  161  5e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.875771 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0130a  5S ribosomal RNA  95.05 
 
 		 120 bp  161  5e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000239315  normal  0.0771518 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0132  5S ribosomal RNA  95.05 
 
 		 120 bp  161  5e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000272918  normal  0.0785427 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0138  5S ribosomal RNA  95.05 
 
 		 120 bp  161  5e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0141  5S ribosomal RNA  95.05 
 
 		 120 bp  161  5e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0054  5S ribosomal RNA  95.88 
 
 		 116 bp  161  5e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.38637  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0154  5S ribosomal RNA  95.88 
 
 		 116 bp  161  5e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000904892 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0147  5S ribosomal RNA  95.88 
 
 		 116 bp  161  5e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.139148 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0160  5S ribosomal RNA  95.88 
 
 		 116 bp  161  5e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00816321  hitchhiker  0.0000000341185 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0136  5S ribosomal RNA  95.88 
 
 		 116 bp  161  5e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00131567 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0144  5S ribosomal RNA  95.88 
 
 		 116 bp  161  5e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.166391  hitchhiker  0.000347328 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0163  5S ribosomal RNA  95.88 
 
 		 116 bp  161  5e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000112315  hitchhiker  0.0000000360962 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0003  5S ribosomal RNA  95.88 
 
 		 116 bp  161  5e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0005  5S ribosomal RNA  95.88 
 
 		 121 bp  161  5e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0611627 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0011  5S ribosomal RNA  95.88 
 
 		 121 bp  161  5e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0378607 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0081  5S ribosomal RNA  95.88 
 
 		 132 bp  161  5e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0102  5S ribosomal RNA  95.88 
 
 		 121 bp  161  5e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0313304  normal  0.0786224 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0109  5S ribosomal RNA  95.88 
 
 		 121 bp  161  5e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0125839 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0112  5S ribosomal RNA  95.88 
 
 		 121 bp  161  5e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0502775  hitchhiker  0.0010565 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0114  5S ribosomal RNA  95.88 
 
 		 132 bp  161  5e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0473719  hitchhiker  0.000221991 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0120  5S ribosomal RNA  95.88 
 
 		 121 bp  161  5e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0534587 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0123  5S ribosomal RNA  95.88 
 
 		 121 bp  161  5e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.719987  normal  0.315089 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0019  5S ribosomal RNA  95.88 
 
 		 116 bp  161  5e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000123433  hitchhiker  0.00199747 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0022  5S ribosomal RNA  95.88 
 
 		 116 bp  161  5e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00178956 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0014  5S ribosomal RNA  95.88 
 
 		 116 bp  161  5e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0199784  hitchhiker  0.000422489 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0017  5S ribosomal RNA  95.88 
 
 		 116 bp  161  5e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000137691  hitchhiker  0.00185628 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0003  5S ribosomal RNA  95.05 
 
 		 121 bp  161  5e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.685817  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0007  5S ribosomal RNA  95.05 
 
 		 121 bp  161  5e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0013  5S ribosomal RNA  95.05 
 
 		 121 bp  161  5e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.84229  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0015  5S ribosomal RNA  95.05 
 
 		 120 bp  161  5e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.832778  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0064  5S ribosomal RNA  95.05 
 
 		 121 bp  161  5e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.648247  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0111  5S ribosomal RNA  95.05 
 
 		 121 bp  161  5e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0121  5S ribosomal RNA  95.05 
 
 		 120 bp  161  5e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.667113  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0005  5S ribosomal RNA  93.46 
 
 		 116 bp  157  8e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.251445 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0017  5S ribosomal RNA  93.46 
 
 		 116 bp  157  8e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0034  5S ribosomal RNA  93.46 
 
 		 116 bp  157  8e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0089  5S ribosomal RNA  93.46 
 
 		 116 bp  157  8e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>