295 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I3114r on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011312  VSAL_I3091r  5S ribosomal RNA  100 
 
 
120 bp  238  3e-61  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.211097  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3084r  5S ribosomal RNA  100 
 
 
120 bp  238  3e-61  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.00000384102  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3109r  5S ribosomal RNA  100 
 
 
120 bp  238  3e-61  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0264558  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3073r  5S ribosomal RNA  100 
 
 
120 bp  238  3e-61  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.00000752328  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3182r  5S ribosomal RNA  100 
 
 
120 bp  238  3e-61  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.175468  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3139r  5S ribosomal RNA  100 
 
 
120 bp  238  3e-61  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.604121  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3210r  5S ribosomal RNA  100 
 
 
121 bp  238  3e-61  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3186r  5S ribosomal RNA  100 
 
 
120 bp  238  3e-61  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.713865  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3114r  5S ribosomal RNA  100 
 
 
120 bp  238  3e-61  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3094r  5S ribosomal RNA  100 
 
 
120 bp  238  3e-61  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3078r  5S ribosomal RNA  99.17 
 
 
120 bp  230  6e-59  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.00000647094  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1115r  5S ribosomal RNA  99.17 
 
 
120 bp  230  6e-59  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.155986  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3096r  5S ribosomal RNA  97.35 
 
 
121 bp  200  6e-50  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna091  5S ribosomal RNA  95.87 
 
 
121 bp  192  1e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.010484  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna077  5S ribosomal RNA  95.04 
 
 
121 bp  184  3e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000940353  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna023  5S ribosomal RNA  95.04 
 
 
121 bp  184  3e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna042  5S ribosomal RNA  95.04 
 
 
121 bp  184  3e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna054  5S ribosomal RNA  95.04 
 
 
121 bp  184  3e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000122961  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna046  5S ribosomal RNA  95.04 
 
 
121 bp  184  3e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna060  5S ribosomal RNA  95.04 
 
 
121 bp  184  3e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna089  5S ribosomal RNA  95.04 
 
 
121 bp  184  3e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.011168  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna035  5S ribosomal RNA  95.04 
 
 
121 bp  184  3e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna154  5S ribosomal RNA  95.04 
 
 
121 bp  184  3e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna082  5S ribosomal RNA  95.04 
 
 
121 bp  184  3e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_rna010  5S ribosomal RNA  95.04 
 
 
121 bp  184  3e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0246  5S ribosomal RNA  94.17 
 
 
121 bp  182  1e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.25142  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2456  5S ribosomal RNA  94.17 
 
 
124 bp  182  1e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2325  5S ribosomal RNA  94.17 
 
 
123 bp  182  1e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2071  5S ribosomal RNA  94.17 
 
 
124 bp  182  1e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2334  5S ribosomal RNA  94.12 
 
 
124 bp  180  4.999999999999999e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000925408  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2712  5S ribosomal RNA  93.33 
 
 
121 bp  174  2.9999999999999996e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000024444  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2547  5S ribosomal RNA  93.33 
 
 
121 bp  174  2.9999999999999996e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.29025  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2805  5S ribosomal RNA  93.33 
 
 
121 bp  174  2.9999999999999996e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.143607  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2069a  5S ribosomal RNA  93.16 
 
 
124 bp  168  2e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0061  5S ribosomal RNA  92.92 
 
 
116 bp  161  5e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.488897 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0111  5S ribosomal RNA  92.17 
 
 
121 bp  157  8e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0121  5S ribosomal RNA  92.17 
 
 
120 bp  157  8e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.667113  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0064  5S ribosomal RNA  92.17 
 
 
121 bp  157  8e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.648247  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0128  5S ribosomal RNA  92.17 
 
 
121 bp  157  8e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0015  5S ribosomal RNA  92.17 
 
 
120 bp  157  8e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.832778  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_r003  5S ribosomal RNA  92.17 
 
 
120 bp  157  8e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_r006  5S ribosomal RNA  92.17 
 
 
120 bp  157  8e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_r009  5S ribosomal RNA  92.17 
 
 
120 bp  157  8e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_r010  5S ribosomal RNA  92.17 
 
 
120 bp  157  8e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_r013  5S ribosomal RNA  92.17 
 
 
120 bp  157  8e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_r016  5S ribosomal RNA  92.17 
 
 
120 bp  157  8e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_r022  5S ribosomal RNA  92.17 
 
 
120 bp  157  8e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_r025  5S ribosomal RNA  92.17 
 
 
120 bp  157  8e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0118  5S ribosomal RNA  92.17 
 
 
120 bp  157  8e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0128  5S ribosomal RNA  92.17 
 
 
120 bp  157  8e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.875771 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0132  5S ribosomal RNA  92.17 
 
 
120 bp  157  8e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000272918  normal  0.0785427 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0138  5S ribosomal RNA  92.17 
 
 
120 bp  157  8e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0141  5S ribosomal RNA  92.17 
 
 
120 bp  157  8e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0003  5S ribosomal RNA  92.17 
 
 
121 bp  157  8e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.685817  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0007  5S ribosomal RNA  92.17 
 
 
121 bp  157  8e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0013  5S ribosomal RNA  92.17 
 
 
121 bp  157  8e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.84229  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0003  5S ribosomal RNA  92.11 
 
 
120 bp  155  2.9999999999999998e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.95198  hitchhiker  0.000000732867 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0018  5S ribosomal RNA  92.11 
 
 
120 bp  155  2.9999999999999998e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000011379 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0073  5S ribosomal RNA  92.11 
 
 
120 bp  155  2.9999999999999998e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.568148  normal  0.279617 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0003  5S ribosomal RNA  92.04 
 
 
116 bp  153  1e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.530292  hitchhiker  0.00148458 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0011  5S ribosomal RNA  92.04 
 
 
116 bp  153  1e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0219912  normal  0.295401 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0018  5S ribosomal RNA  92.04 
 
 
116 bp  153  1e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000474552 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0075  5S ribosomal RNA  92.04 
 
 
116 bp  153  1e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0121  5S ribosomal RNA  92.04 
 
 
116 bp  153  1e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.777724 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0130  5S ribosomal RNA  92.04 
 
 
116 bp  153  1e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.799591 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0134  5S ribosomal RNA  92.04 
 
 
116 bp  153  1e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00025818  hitchhiker  0.00693749 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0138  5S ribosomal RNA  92.04 
 
 
116 bp  153  1e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0141  5S ribosomal RNA  92.04 
 
 
116 bp  153  1e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.232232 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0003  5S ribosomal RNA  92.04 
 
 
116 bp  153  1e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.377147  hitchhiker  0.00225756 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0011  5S ribosomal RNA  92.04 
 
 
116 bp  153  1e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00932419 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0018  5S ribosomal RNA  92.04 
 
 
116 bp  153  1e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.374169 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0024  5S ribosomal RNA  92.04 
 
 
116 bp  153  1e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000358593  normal  0.0497188 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0028  5S ribosomal RNA  92.04 
 
 
116 bp  153  1e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.966911 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0075  5S ribosomal RNA  92.04 
 
 
116 bp  153  1e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.110925 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0121  5S ribosomal RNA  92.04 
 
 
116 bp  153  1e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.676383 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0139  5S ribosomal RNA  92.04 
 
 
116 bp  153  1e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0142  5S ribosomal RNA  92.04 
 
 
116 bp  153  1e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03612  5S ribosomal RNA  92.31 
 
 
117 bp  153  1e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00472  5S ribosomal RNA  92.31 
 
 
117 bp  153  1e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01013  5S ribosomal RNA  92.31 
 
 
117 bp  153  1e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00374  5S ribosomal RNA  92.31 
 
 
117 bp  153  1e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00247  5S ribosomal RNA  92.31 
 
 
117 bp  153  1e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0005  5S ribosomal RNA  92.04 
 
 
116 bp  153  1e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.251445 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0009  5S ribosomal RNA  92.04 
 
 
116 bp  153  1e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0017  5S ribosomal RNA  92.04 
 
 
116 bp  153  1e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0034  5S ribosomal RNA  92.04 
 
 
116 bp  153  1e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0101  5S ribosomal RNA  92.04 
 
 
116 bp  153  1e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0104  5S ribosomal RNA  92.04 
 
 
116 bp  153  1e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0076366 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0108  5S ribosomal RNA  92.04 
 
 
116 bp  153  1e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.329988 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03717  5S ribosomal RNA  92.31 
 
 
117 bp  153  1e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06827  5S ribosomal RNA  92.31 
 
 
117 bp  153  1e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00326  5S ribosomal RNA  92.31 
 
 
117 bp  153  1e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00199  5S ribosomal RNA  92.31 
 
 
117 bp  153  1e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00193  5S ribosomal RNA  92.31 
 
 
117 bp  153  1e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_r019  5S ribosomal RNA  91.96 
 
 
120 bp  151  5e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0395  hypothetical protein  91.96 
 
 
129 bp  151  5e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000730757  normal  0.0497188 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0130a  5S ribosomal RNA  91.96 
 
 
120 bp  151  5e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000239315  normal  0.0771518 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0089  5S ribosomal RNA  91.96 
 
 
116 bp  151  5e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0023  5S ribosomal RNA  91.3 
 
 
120 bp  149  2.0000000000000003e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0011  5S ribosomal RNA  91.23 
 
 
120 bp  147  7.0000000000000006e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.410694  normal  0.754666 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>