15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I1409 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011312  VSAL_I0285    99.9 
 
 		 1349 bp  1986    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0743    99.9 
 
 		 2312 bp  1984    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0971    99.9 
 
 		 2219 bp  1986    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1409    100 
 
 		 2567 bp  5089    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.169992  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1440    99.9 
 
 		 1355 bp  1986    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.368011  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2468    99.8 
 
 		 2102 bp  1976    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2720    99.8 
 
 		 2729 bp  1976    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0157    99.9 
 
 		 2801 bp  1984    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2612    96.23 
 
 		 341 bp  89.7  0.000000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.35106  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000659  putative glycine betaine transporter  92.06 
 
 		 1587 bp  85.7  0.00000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2126  BCCT transporter  87.1 
 
 		 1602 bp  60  0.000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00109884  hitchhiker  0.00218719 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0815  BCCT transporter  88.68 
 
 		 1593 bp  58  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.820785  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1813  BCCT transporter  94.29 
 
 		 1686 bp  54  0.0002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.566263 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5237  BCCT transporter  89.13 
 
 		 1569 bp  52  0.0008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5625  osmoprotectant transporter, BCCT family  89.13 
 
 		 1569 bp  52  0.0008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>