15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_01959 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_01959  hypothetical protein  100 
 
 		 173 aa  358  1e-98  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1069  putative DNA methyltransferase  45.68 
 
 		 205 aa  132  1.9999999999999998e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0711  hypothetical protein  44.23 
 
 		 188 aa  124  8.000000000000001e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.025726 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6985  hypothetical protein  32.4 
 
 		 226 aa  60.5  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0657  hypothetical protein  31.11 
 
 		 250 aa  57  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1849  methyltransferase small  30.72 
 
 		 235 aa  55.5  0.0000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.105583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0059  hypothetical protein  29.28 
 
 		 189 aa  53.5  0.000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.459485  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2625  hypothetical protein  27.68 
 
 		 227 aa  53.1  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.923126  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0325  hypothetical protein  29.38 
 
 		 231 aa  51.6  0.000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000884213  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6273  hypothetical protein  28.48 
 
 		 226 aa  50.8  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0521  hypothetical protein  26.83 
 
 		 205 aa  48.1  0.00006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5719  hypothetical protein  28.14 
 
 		 205 aa  45.8  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0329  type I restriction-modification system methyltransferase subunit-like protein  31.46 
 
 		 557 aa  42.7  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2441  hypothetical protein  25.75 
 
 		 207 aa  41.6  0.005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.339442  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1911  hypothetical protein  27.75 
 
 		 215 aa  41.2  0.007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>