61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_004092 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013456  VEA_004092  starvation lipoprotein Slp like protein  100 
 
 
185 aa  380  1e-105  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01377  hypothetical protein  81.08 
 
 
185 aa  325  3e-88  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1572  putative outer membrane lipoprotein Slp  47.95 
 
 
202 aa  178  4e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.178723  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0908  outer membrane lipoprotein, Slp family  45.83 
 
 
185 aa  162  3e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2806  Slp family outer membrane lipoprotein  39.86 
 
 
198 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0323453  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2348  outer membrane lipoprotein, Slp family  37.5 
 
 
190 aa  104  8e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.189475  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1992  outer membrane lipoprotein, Slp family  38.57 
 
 
209 aa  102  2e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.644744  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2011  outer membrane lipoprotein, Slp family  37.14 
 
 
205 aa  101  8e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.793199  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2015  Slp family outer membrane lipoprotein  35.03 
 
 
195 aa  99.8  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000421651  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2126  Slp family outer membrane lipoprotein  35.03 
 
 
201 aa  100  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2404  Slp family outer membrane lipoprotein  35.03 
 
 
201 aa  100  2e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000394448  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2230  outer membrane lipoprotein, Slp family  34.01 
 
 
207 aa  98.2  5e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0678986  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1382  outer membrane protein Slp  33.95 
 
 
193 aa  96.3  2e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.387794  normal  0.55237 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1935  outer membrane lipoprotein, Slp family  34.56 
 
 
214 aa  96.3  3e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.655428  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01135  Starvation-inducible outer membrane lipoprotein  30.13 
 
 
218 aa  95.1  5e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2761  Slp family outer membrane lipoprotein  34.64 
 
 
196 aa  94.7  6e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000231326  hitchhiker  0.00115108 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2533  outer membrane protein Slp  34.69 
 
 
193 aa  94.7  6e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.31032  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2066  outer membrane protein Slp  33.54 
 
 
193 aa  94.4  9e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1837  outer membrane lipoprotein, Slp family  34.69 
 
 
193 aa  94  1e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000126443  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2032  outer membrane protein Slp  34.69 
 
 
193 aa  94  1e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1894  outer membrane protein Slp  34.69 
 
 
193 aa  94  1e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2376  Slp family outer membrane lipoprotein  32.24 
 
 
193 aa  93.6  2e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2020  outer membrane protein Slp  33.55 
 
 
193 aa  92.8  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.251668  normal  0.377437 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1497  outer membrane protein Slp  33.55 
 
 
193 aa  92.8  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.443162  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2173  Slp family outer membrane lipoprotein  31.06 
 
 
189 aa  92.8  3e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1312  outer membrane protein Slp  33.55 
 
 
193 aa  92.8  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0266673  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1959  outer membrane protein Slp  33.55 
 
 
193 aa  92.8  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.286575  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1827  Slp family outer membrane lipoprotein  34.69 
 
 
193 aa  92  4e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.64405  normal  0.397097 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01764  hypothetical protein  34.01 
 
 
193 aa  92  4e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.736998  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01776  predicted lipoprotein  34.01 
 
 
193 aa  92  4e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.994959  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1963  outer membrane protein Slp  33.55 
 
 
193 aa  91.3  7e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2347  outer membrane lipoprotein Slp  36.36 
 
 
155 aa  87.8  8e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.831306  normal  0.890388 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2420  outer membrane lipoprotein Slp  31.65 
 
 
181 aa  86.7  2e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.736746  normal  0.0108754 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0667  outer membrane lipoprotein, Slp family  32.19 
 
 
185 aa  84.7  8e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0668  outer membrane lipoprotein Slp  31.25 
 
 
165 aa  82  0.000000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02439  outer membrane protein Slp  33.11 
 
 
166 aa  80.9  0.000000000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2172  outer membrane lipoprotein Slp  32.37 
 
 
177 aa  79.7  0.00000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3799  Slp family outer membrane lipoprotein  32.65 
 
 
240 aa  78.6  0.00000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.266438 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0861  outer membrane lipoprotein Slp  29.41 
 
 
175 aa  78.6  0.00000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0211  Slp family outer membrane lipoprotein  32.65 
 
 
188 aa  77.8  0.00000000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0656913 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03307  hypothetical protein  32.65 
 
 
188 aa  77.8  0.00000000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.656334  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4854  outer membrane lipoprotein, Slp family  32.65 
 
 
188 aa  77.8  0.00000000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03354  outer membrane lipoprotein  32.65 
 
 
188 aa  77.8  0.00000000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.566585  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3992  Slp family outer membrane lipoprotein  32.65 
 
 
188 aa  77.8  0.00000000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3708  Slp family outer membrane lipoprotein  32.65 
 
 
188 aa  77.8  0.00000000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00034327  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3904  outer membrane lipoprotein, Slp family  32.65 
 
 
188 aa  77.8  0.00000000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0208  outer membrane lipoprotein, Slp family  32.65 
 
 
188 aa  77.4  0.0000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2419  outer membrane lipoprotein Slp  33.06 
 
 
166 aa  77.4  0.0000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0101966 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2260  Slp family outer membrane lipoprotein  29.94 
 
 
181 aa  77  0.0000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.349564  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1325  Outer membrane lipoprotein Slp  31.91 
 
 
171 aa  75.1  0.0000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1817  Slp family outer membrane lipoprotein  29.14 
 
 
189 aa  67.4  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.42187  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2057  outer membrane lipoprotein Slp  31.15 
 
 
186 aa  65.1  0.0000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000642718  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2207  outer membrane lipoprotein Slp  24.57 
 
 
183 aa  63.9  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1619  Outer membrane lipoprotein Slp  38.3 
 
 
167 aa  63.2  0.000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1429  Outer membrane lipoprotein Slp  31.63 
 
 
190 aa  61.6  0.000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00755368  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0543  Slp family outer membrane lipoprotein  25.85 
 
 
165 aa  61.6  0.000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2316  outer membrane lipoprotein Slp, putative  29.63 
 
 
178 aa  60.8  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.884572  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1956  outer membrane lipoprotein Slp  29.63 
 
 
178 aa  60.8  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.202475  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2184  Slp family outer membrane lipoprotein  30.5 
 
 
204 aa  55.8  0.0000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3107  putative starvation-inducible outer membrane lipoprotein  29.37 
 
 
179 aa  53.9  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1119  outer membrane lipoprotein Slp  32.53 
 
 
107 aa  50.8  0.00001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>