29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_001110 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013457  VEA_001110  hypothetical protein  100 
 
 
245 aa  495  1e-139  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.185501  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04863  hypothetical protein  93.9 
 
 
246 aa  466  9.999999999999999e-131  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0226  hypothetical protein  84.98 
 
 
243 aa  412  1e-114  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0778  nucleoside recognition domain protein  51.04 
 
 
231 aa  201  9e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0109514 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4770  transporter gate domain protein  44.35 
 
 
223 aa  195  5.000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4918  transporter gate domain-containing protein  44.35 
 
 
223 aa  195  5.000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.263259  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4917  transporter gate domain-containing protein  43.91 
 
 
223 aa  194  7e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.256972 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4845  transporter gate domain protein  43.91 
 
 
223 aa  194  7e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4869  transporter gate domain protein  43.91 
 
 
223 aa  194  7e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.449114  normal  0.562871 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2630  nucleoside recognition domain protein  43.97 
 
 
224 aa  192  4e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3666  nucleoside recognition domain protein  43.11 
 
 
227 aa  178  8e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000164437  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5838  putative transporter  43.11 
 
 
227 aa  178  8e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.859989 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4873  putative transporter  43.11 
 
 
227 aa  178  8e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04199  conserved inner membrane protein  43.11 
 
 
227 aa  178  8e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000688041  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4558  putative transporter  43.11 
 
 
227 aa  178  8e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4929  putative transporter  43.11 
 
 
227 aa  178  8e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3734  nucleoside recognition domain-containing protein  43.11 
 
 
227 aa  178  8e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00796252  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4775  putative transporter  43.11 
 
 
227 aa  178  8e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04161  hypothetical protein  44.23 
 
 
196 aa  169  5e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000325835  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1335  putative endonuclease  41.26 
 
 
210 aa  160  2e-38  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.156209  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1274  nucleoside recognition  25.83 
 
 
435 aa  44.3  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.174951  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1794  hypothetical protein  32.35 
 
 
451 aa  43.9  0.002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00298391  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1774  hypothetical protein  31.11 
 
 
457 aa  43.5  0.003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.32184  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4917  hypothetical protein  30.39 
 
 
153 aa  43.1  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.602159  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4769  hypothetical protein  30.39 
 
 
153 aa  43.1  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4844  hypothetical protein  30.39 
 
 
153 aa  43.1  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4868  hypothetical protein  30.39 
 
 
153 aa  43.1  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.530849 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4916  hypothetical protein  30.39 
 
 
153 aa  43.1  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.803574  normal  0.306844 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1878  sporulation integral membrane protein YlbJ  26.35 
 
 
424 aa  42.4  0.007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.169606  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>