28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_04863 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_04863  hypothetical protein  100 
 
 		 246 aa  498  1e-140  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001110  hypothetical protein  93.9 
 
 		 245 aa  466  9.999999999999999e-131  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.185501  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0226  hypothetical protein  81.63 
 
 		 243 aa  404  1e-111  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0778  nucleoside recognition domain protein  52.5 
 
 		 231 aa  207  2e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0109514 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2630  nucleoside recognition domain protein  45.13 
 
 		 224 aa  195  5.000000000000001e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4917  transporter gate domain-containing protein  43.72 
 
 		 223 aa  193  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.256972 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4845  transporter gate domain protein  43.72 
 
 		 223 aa  193  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4770  transporter gate domain protein  44.16 
 
 		 223 aa  194  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4918  transporter gate domain-containing protein  44.16 
 
 		 223 aa  194  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.263259  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4869  transporter gate domain protein  43.72 
 
 		 223 aa  193  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.449114  normal  0.562871 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3666  nucleoside recognition domain protein  44.3 
 
 		 227 aa  184  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000164437  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5838  putative transporter  44.3 
 
 		 227 aa  184  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.859989 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4775  putative transporter  44.3 
 
 		 227 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4873  putative transporter  44.3 
 
 		 227 aa  184  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4929  putative transporter  44.3 
 
 		 227 aa  184  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4558  putative transporter  44.3 
 
 		 227 aa  184  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04199  conserved inner membrane protein  44.3 
 
 		 227 aa  184  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000688041  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3734  nucleoside recognition domain-containing protein  44.3 
 
 		 227 aa  183  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00796252  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04161  hypothetical protein  44.98 
 
 		 196 aa  172  5e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000325835  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1335  putative endonuclease  43.06 
 
 		 210 aa  164  1.0000000000000001e-39  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.156209  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1794  hypothetical protein  32.35 
 
 		 451 aa  43.5  0.003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00298391  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1774  hypothetical protein  31.11 
 
 		 457 aa  43.5  0.003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.32184  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4868  hypothetical protein  30.39 
 
 		 153 aa  42.7  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.530849 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4917  hypothetical protein  30.39 
 
 		 153 aa  42.7  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.602159  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4769  hypothetical protein  30.39 
 
 		 153 aa  42.7  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4844  hypothetical protein  30.39 
 
 		 153 aa  42.7  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4916  hypothetical protein  30.39 
 
 		 153 aa  42.7  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.803574  normal  0.306844 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1274  nucleoside recognition  26.71 
 
 		 435 aa  42.4  0.007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.174951  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>