31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_0906 on replicon NC_009456
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009456  VC0395_0906  hypothetical protein  100 
 
 		 188 aa  387  1e-107  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1418  hypothetical protein  33.75 
 
 		 173 aa  91.7  6e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.803078  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3181  protein of unknown function UPF0157  34.48 
 
 		 175 aa  83.6  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0196376  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1602  protein of unknown function UPF0157  32.28 
 
 		 165 aa  82.8  0.000000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2737  hypothetical protein  32.03 
 
 		 187 aa  72  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.809483  normal  0.132345 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02587  hypothetical protein  30.71 
 
 		 143 aa  55.1  0.0000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0322  protein of unknown function UPF0157  33.81 
 
 		 173 aa  54.3  0.000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.169012  normal  0.0199822 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2809  protein of unknown function UPF0157  27.04 
 
 		 406 aa  51.6  0.000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1290  protein of unknown function UPF0157  31.93 
 
 		 375 aa  50.1  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0552  hypothetical protein  27.94 
 
 		 347 aa  48.5  0.00006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0837  hypothetical protein  62.86 
 
 		 63 aa  47.8  0.00009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.533353  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63380  hypothetical protein  26.57 
 
 		 242 aa  47  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.903165  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1483  hypothetical protein  27.38 
 
 		 197 aa  46.6  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.496264  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2985  hypothetical protein  30.08 
 
 		 181 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0439608 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0920  hypothetical protein  27.34 
 
 		 169 aa  47  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3103  hypothetical protein  29.77 
 
 		 171 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0343219  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1571  hypothetical protein  29.19 
 
 		 365 aa  46.2  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.332111  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4110  protein of unknown function UPF0157  25.14 
 
 		 170 aa  45.4  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2708  hypothetical protein  28.03 
 
 		 171 aa  45.4  0.0005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.95734  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2507  protein of unknown function UPF0157  27.78 
 
 		 171 aa  43.9  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.309459  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2990  protein of unknown function UPF0157  27.03 
 
 		 171 aa  43.5  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.377938  normal  0.0790959 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0759  protein of unknown function UPF0157  25 
 
 		 190 aa  42.7  0.003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0605  protein of unknown function UPF0157  26.04 
 
 		 185 aa  42.7  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0204  protein of unknown function UPF0157  25.55 
 
 		 178 aa  42.7  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.358408 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2729  protein of unknown function UPF0157  26.11 
 
 		 170 aa  42.4  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.208995  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1089  hypothetical protein  26.35 
 
 		 601 aa  42  0.006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4207  protein of unknown function UPF0157  26.58 
 
 		 198 aa  41.6  0.007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.573704  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2591  hypothetical protein  25.38 
 
 		 169 aa  41.2  0.009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.12292  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2779  hypothetical protein  25.38 
 
 		 169 aa  41.2  0.009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0119576  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06714  hypothetical protein  25 
 
 		 173 aa  40.8  0.01  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2329  hypothetical protein  26.43 
 
 		 173 aa  40.8  0.01  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.177131  normal  0.089639 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>