64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_R0046 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013525  Tter_R0046  tRNA-Arg  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002620  tRNA-Arg-3  tRNA-Arg  89.83 
 
 
74 bp  61.9  0.00000002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0009  tRNA-Arg  89.09 
 
 
73 bp  61.9  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00118273  normal  0.0247339 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0057  tRNA-Arg  89.09 
 
 
76 bp  61.9  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.783183  normal  0.0478454 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0007  tRNA-Arg  89.09 
 
 
76 bp  61.9  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0005  tRNA-Arg  89.09 
 
 
73 bp  61.9  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.134244  hitchhiker  0.00821182 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0055  tRNA-Arg  89.09 
 
 
76 bp  61.9  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0007  tRNA-Arg  89.09 
 
 
73 bp  61.9  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0054  tRNA-Arg  89.09 
 
 
73 bp  61.9  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0061  tRNA-Arg  89.09 
 
 
73 bp  61.9  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.381329 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0057  tRNA-Arg  89.09 
 
 
73 bp  61.9  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.32045  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0009  tRNA-Arg  89.09 
 
 
73 bp  61.9  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0056  tRNA-Arg  89.09 
 
 
73 bp  61.9  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0006  tRNA-Arg  87.93 
 
 
73 bp  60  0.00000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_R0007  tRNA-Arg  89.8 
 
 
77 bp  58  0.0000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0847038  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0005  tRNA-Arg  87.27 
 
 
73 bp  54  0.000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0008  tRNA-Arg  87.27 
 
 
76 bp  54  0.000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.56031  normal  0.0314068 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0007  tRNA-Arg  87.27 
 
 
76 bp  54  0.000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.866395  normal  0.129572 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26100  tRNA-Arg  87.27 
 
 
73 bp  54  0.000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0006  tRNA-Arg  87.27 
 
 
73 bp  54  0.000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0006  tRNA-Arg  87.27 
 
 
73 bp  54  0.000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01900  tRNA-Arg  87.27 
 
 
76 bp  54  0.000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.952445 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0063  tRNA-Arg  87.27 
 
 
76 bp  54  0.000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0057  tRNA-Arg  87.27 
 
 
76 bp  54  0.000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.921424  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_R0009  tRNA-Arg  87.27 
 
 
73 bp  54  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02200  tRNA-Arg  87.27 
 
 
76 bp  54  0.000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_R0038  tRNA-Arg  89.13 
 
 
77 bp  52  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.427754  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0006  tRNA-Arg  86.21 
 
 
73 bp  52  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.652554  normal  0.867561 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0114  tRNA-Arg  89.13 
 
 
77 bp  52  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00529639  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0115  tRNA-Arg  89.13 
 
 
77 bp  52  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000730422  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0116  tRNA-Arg  89.13 
 
 
77 bp  52  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000643012  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0008  tRNA-Arg  90.48 
 
 
77 bp  52  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.119735  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0009  tRNA-Arg  90.48 
 
 
77 bp  52  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.190028  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0080  tRNA-Arg  87.76 
 
 
77 bp  50.1  0.00007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000233743  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0053  tRNA-Arg  87.76 
 
 
77 bp  50.1  0.00007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.361533 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0111  tRNA-Arg  87.76 
 
 
74 bp  50.1  0.00007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0080  tRNA-Arg  87.76 
 
 
74 bp  50.1  0.00007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0062  tRNA-Arg  87.76 
 
 
77 bp  50.1  0.00007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0020  tRNA-Arg  87.76 
 
 
74 bp  50.1  0.00007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0029  tRNA-Arg  87.76 
 
 
77 bp  50.1  0.00007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000030616  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0030  tRNA-Arg  87.76 
 
 
77 bp  50.1  0.00007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000300498  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0028  tRNA-Arg  87.76 
 
 
77 bp  50.1  0.00007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000292353  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0077  tRNA-Arg  87.76 
 
 
77 bp  50.1  0.00007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000716248  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0079  tRNA-Arg  87.76 
 
 
77 bp  50.1  0.00007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000061602  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0081  tRNA-Arg  87.76 
 
 
77 bp  50.1  0.00007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000923685  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0082  tRNA-Arg  87.76 
 
 
77 bp  50.1  0.00007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000302683  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0070  tRNA-Arg  87.76 
 
 
74 bp  50.1  0.00007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0135947  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0050  tRNA-Arg  87.76 
 
 
77 bp  50.1  0.00007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000344943  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0023  tRNA-Arg  87.76 
 
 
77 bp  50.1  0.00007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.157994  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0027  tRNA-Arg  87.76 
 
 
77 bp  50.1  0.00007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000312011  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0083  tRNA-Arg  87.76 
 
 
77 bp  50.1  0.00007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000215013  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0061  tRNA-Arg  86.27 
 
 
73 bp  46.1  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0005  tRNA-Arg  85.45 
 
 
73 bp  46.1  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0040  tRNA-Arg  87.27 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0238659  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27060  tRNA-Arg  85.45 
 
 
73 bp  46.1  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.14879  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0006  tRNA-Arg  86.27 
 
 
73 bp  46.1  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0483173  normal  0.730879 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0025  tRNA-Arg  87.23 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0024  tRNA-Arg  87.23 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0052  tRNA-Arg  86.27 
 
 
73 bp  46.1  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.483727  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0019  tRNA-Arg  86.27 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0771272  normal  0.535237 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0051  tRNA-Arg  86.27 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00230121 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0044  tRNA-Arg  86.21 
 
 
77 bp  44.1  0.005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_R0019  tRNA-Arg  89.47 
 
 
77 bp  44.1  0.005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0224429  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14043  tRNA-Arg  85.19 
 
 
73 bp  44.1  0.005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0938748  normal  0.536997 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>