169 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene tRNA-Arg-3 on replicon NC_002620
Organism: Chlamydia muridarum Nigg



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002620  tRNA-Arg-3  tRNA-Arg  100 
 
 		 74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0064  tRNA-Arg  92.45 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00996897  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0045  tRNA-Arg  92.45 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000739134 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0029  tRNA-Arg  92.45 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0040  tRNA-Arg  89.66 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0409626  hitchhiker  0.00769115 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0053  tRNA-Arg  89.66 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000298412  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0050  tRNA-Arg  89.66 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000319175  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0043  tRNA-Arg  89.66 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0814997  hitchhiker  0.00811057 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0055  tRNA-Arg  89.66 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000268811  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0056  tRNA-Arg  89.66 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000025331  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna108  tRNA-Arg  89.66 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000789461  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0037  tRNA-Arg  89.66 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0424751  hitchhiker  0.00773647 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03504  tRNA-Arg  89.66 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0034  tRNA-Arg  89.66 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0228337  hitchhiker  0.00733773 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03503  tRNA-Arg  89.66 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03506  tRNA-Arg  89.66 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0020  tRNA-Arg  89.66 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000211793  normal  0.0116052 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna109  tRNA-Arg  89.66 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000319749  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03502  tRNA-Arg  89.66 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03501  tRNA-Arg  89.66 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna111  tRNA-Arg  89.66 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00293303  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0035  tRNA-Arg  89.66 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.042903  hitchhiker  0.00756104 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0041  tRNA-Arg  89.66 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0453151  hitchhiker  0.00788518 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0042  tRNA-Arg  89.66 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.046483  hitchhiker  0.00783232 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0051  tRNA-Arg  89.66 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000808669  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0052  tRNA-Arg  89.66 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000305181  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0039  tRNA-Arg  89.66 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0446173  hitchhiker  0.00751458 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna114  tRNA-Arg  89.66 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0142172  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0022  tRNA-Arg  89.66 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00548684  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0023  tRNA-Arg  89.66 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00552371  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03500  tRNA-Arg  89.66 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna106  tRNA-Arg  89.66 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000169695  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0049  tRNA-Arg  89.66 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000321594  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna110  tRNA-Arg  89.66 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00293303  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna113  tRNA-Arg  89.66 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00652394  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna112  tRNA-Arg  89.66 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00685075  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0109  tRNA-Arg  89.66 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00006448 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0108  tRNA-Arg  89.66 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000608145 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0107  tRNA-Arg  89.66 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000608145 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0110  tRNA-Arg  89.66 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.607577  hitchhiker  0.0000634029 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0112  tRNA-Arg  89.66 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.456139  hitchhiker  0.0000639392 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0114  tRNA-Arg  89.66 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.195511  hitchhiker  0.0000613432 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0115  tRNA-Arg  89.66 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.125071  hitchhiker  0.0000608145 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0113  tRNA-Arg  89.66 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.196307  hitchhiker  0.0000602904 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0036  tRNA-Arg  89.66 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.042903  hitchhiker  0.00773647 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03499  tRNA-Arg  89.66 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t083  tRNA-Arg  90.57 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t087  tRNA-Arg  90.57 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t088  tRNA-Arg  90.57 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t089  tRNA-Arg  90.57 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0065  tRNA-Arg  90.57 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00979442  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0043  tRNA-Arg  90.57 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000076274  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0045  tRNA-Arg  90.57 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000811404  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0020  tRNA-Arg  90.57 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.845791  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0047  tRNA-Arg  90.57 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000959117  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0049  tRNA-Arg  90.57 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000951803  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0044  tRNA-Arg  90.57 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000145436  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0046  tRNA-Arg  90.57 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000251633  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0048  tRNA-Arg  90.57 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000258429  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0050  tRNA-Arg  90.57 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000285185  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0042  tRNA-Arg  90.57 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000133594  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0044  tRNA-Arg  90.57 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000151065  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0046  tRNA-Arg  90.57 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000098167  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0048  tRNA-Arg  90.57 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000451917  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0025  tRNA-Arg  90.57 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_R0059  tRNA-Arg  90.57 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00000542339  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0024  tRNA-Arg  90.57 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t086  tRNA-Arg  90.38 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0037  tRNA-Arg  90.38 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000180168  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0038  tRNA-Arg  90.38 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000238811  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0039  tRNA-Arg  90.38 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000255751  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0041  tRNA-Arg  90.38 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000126984  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0118  tRNA-Arg  90.38 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000000119067  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0044  tRNA-Arg  90.38 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000826054  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0047  tRNA-Arg  90.38 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000279999  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0045  tRNA-Arg  90.38 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.24786  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0046  tRNA-Arg  90.38 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.345279  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0047  tRNA-Arg  90.38 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.349818  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0049  tRNA-Arg  90.38 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.871156  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0043  tRNA-Arg  90.38 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000142097  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0045  tRNA-Arg  90.38 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000160555  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0039  tRNA-Arg  90.38 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000292486  normal  0.532289 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0040  tRNA-Arg  90.38 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000315714  normal  0.525194 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0041  tRNA-Arg  90.38 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000275058  normal  0.527619 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0042  tRNA-Arg  90.38 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000264574  normal  0.527619 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0043  tRNA-Arg  90.38 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000028364  normal  0.527619 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0115  tRNA-Arg  90.38 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000013002  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0113  tRNA-Arg  90.38 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000084866  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0089  tRNA-Arg  90.38 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00125706  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0091  tRNA-Arg  90.38 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00116714  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0092  tRNA-Arg  90.38 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00111673  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0093  tRNA-Arg  90.38 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000449843  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0094  tRNA-Arg  90.38 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000391203  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0095  tRNA-Arg  90.38 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000145401  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0117  tRNA-Arg  90.38 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000112266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0104  tRNA-Arg  90.38 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000547181  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0106  tRNA-Arg  90.38 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000188181  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0107  tRNA-Arg  90.38 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000203726  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0108  tRNA-Arg  90.38 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000272922  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0109  tRNA-Arg  90.38 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000932697  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>