130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_R0053 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_R0053  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.361533 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0037  tRNA-Arg  89.23 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.678102  normal  0.176002 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_R0010  tRNA-Arg  89.23 
 
 		 74 bp  73.8  0.000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.552541  hitchhiker  0.000550393 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0043  tRNA-Arg  90.38 
 
 		 74 bp  63.9  0.000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0111  tRNA-Arg  87.3 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0020  tRNA-Arg  87.3 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0070  tRNA-Arg  87.3 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0135947  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0050  tRNA-Arg  87.3 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000344943  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0080  tRNA-Arg  87.3 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0062  tRNA-Arg  87.3 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0023  tRNA-Arg  87.3 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.157994  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_R0038  tRNA-Arg  87.93 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.427754  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR_t05  tRNA-Arg  86.15 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0054    86.15 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_t32  tRNA-Arg  86.15 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0011176  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0013  tRNA-Arg  86.15 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.249758  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0001  tRNA-Arg  86.15 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.336526  hitchhiker  0.00896286 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0006  tRNA-Arg  86.15 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0288  tRNA-Arg  86.15 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.528519  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0006  tRNA-Arg  86.15 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0064  tRNA-Arg  86.15 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.294983  normal  0.0656653 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0058  tRNA-Arg  86.15 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0009  tRNA-Arg  86.15 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0891708  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0067  tRNA-Arg  86.15 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.645419 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0010  tRNA-Arg  86.15 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.312192  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0004  tRNA-Arg  88.68 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.468205  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0011  tRNA-Arg  86.15 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0234667  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0011  tRNA-Arg  86.15 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0068  tRNA-Arg  86.15 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.754645  normal  0.377618 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0008  tRNA-Arg  87.27 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.119735  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0077  tRNA-Arg  85.07 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000716248  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0080  tRNA-Arg  85.07 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000233743  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0082  tRNA-Arg  85.07 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000302683  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0029  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0009  tRNA-Arg  88 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.190028  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0006  tRNA-Arg  86.15 
 
 		 73 bp  50.1  0.00008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0041  tRNA-Arg  84.62 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000000324571  normal  0.101543 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0054  tRNA-Arg  84.62 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.403688  hitchhiker  0.000271304 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0014  tRNA-Arg  84.62 
 
 		 74 bp  50.1  0.00008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0054104  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0038  tRNA-Trp  86.79 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.23193 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0046  tRNA-Arg  87.76 
 
 		 76 bp  50.1  0.00008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0026  tRNA-Arg  84.62 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000000155557  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0048  tRNA-Arg  84.62 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00527947  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0020  tRNA-Arg  84.62 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0945602  normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_R0086  tRNA-Arg  91.89 
 
 		 74 bp  50.1  0.00008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32790  tRNA-Arg  86.54 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_R0001  tRNA-Arg  100 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.383152  normal  0.0513953 
 
 
-
 
NC_008309  HS_tArg02  tRNA-Arg  96.43 
 
 		 80 bp  48.1  0.0003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21050  tRNA-Trp  88.46 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.461019  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Arg-3  tRNA-Arg  84.75 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Arg-4  tRNA-Arg  84.75 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0605047  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR_t09  tRNA-Arg  96.3 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.146869  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0005  tRNA-Asp  96.3 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0326201  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0040  tRNA-Arg  91.43 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0238659  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0030  tRNA-Arg  84.75 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.238826  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0179  tRNA-Arg  84.75 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0079  tRNA-Arg  84.13 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000061602  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0081  tRNA-Arg  84.13 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000923685  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0083  tRNA-Arg  84.13 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000215013  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0040  tRNA-Arg  87.23 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.589748  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA38  tRNA-Trp  90.7 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.997102 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0713  tRNA-Arg  96.3 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0056  tRNA-Arg  91.43 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000119061  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_R0063  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.257054  normal  0.817877 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_R0007  tRNA-Arg  84.13 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0847038  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0042  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0118555  normal  0.877407 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0022  tRNA-Arg  85.45 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.0000000000027529  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0027  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.360005  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_R0048  tRNA-Arg  84.75 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5694  tRNA-Arg  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000635784  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Arg-2  tRNA-Arg  100 
 
 		 80 bp  44.1  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000143078  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Arg-1  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000123447  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Arg-3  tRNA-Arg  100 
 
 		 80 bp  44.1  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000523953  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Arg-4  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.353058  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Arg-5  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Arg-2  tRNA-Arg  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000692763  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Arg-4  tRNA-Arg  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000500778  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0029  tRNA-Trp  90.48 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0051  tRNA-Trp  90.48 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.585976  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0054  tRNA-Trp  90.48 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0023  tRNA-Trp  90.48 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0014  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000000281617  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0056  tRNA-Arg  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0040  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0011  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0037  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0014  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000388984  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0056  tRNA-Arg  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.771364  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0024  tRNA-Arg  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0232798  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0051  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000784073  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0100  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00184606  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0133  tRNA-Arg  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000990226  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0101  tRNA-Arg  100 
 
 		 79 bp  44.1  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00157662  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0299  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000767893  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0860  tRNA-Arg  100 
 
 		 79 bp  44.1  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000046411  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5028  tRNA-Arg  100 
 
 		 79 bp  44.1  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000552339  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5732  tRNA-Arg  100 
 
 		 79 bp  44.1  0.005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000100542  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5813  tRNA-Arg  100 
 
 		 79 bp  44.1  0.005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000449706  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0218  tRNA-Arg  100 
 
 		 79 bp  44.1  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000264905  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4571  tRNA-Arg  100 
 
 		 79 bp  44.1  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000000605128  normal  0.110688 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>