18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_1300 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013525  Tter_1300  UbiA prenyltransferase  100 
 
 
294 aa  580  1.0000000000000001e-165  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2097  UbiA prenyltransferase  35.9 
 
 
288 aa  144  1e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2533  UbiA prenyltransferase  30.18 
 
 
285 aa  113  4.0000000000000004e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.117462 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3793  hypothetical protein  27.08 
 
 
291 aa  80.1  0.00000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.588351  normal  0.105005 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2037  Naringenin-chalcone synthase  29.03 
 
 
656 aa  79.3  0.00000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.629301  normal  0.879643 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1210  bacteriochlorophyll/chlorophyll synthetase  28.4 
 
 
305 aa  47.4  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.441233  normal  0.145879 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1089  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  27.23 
 
 
333 aa  47.4  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0708  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  27.17 
 
 
332 aa  47  0.0004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.630035  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0545  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  27.27 
 
 
330 aa  46.6  0.0005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.659162  normal  0.856578 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1390  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  25.23 
 
 
334 aa  46.6  0.0006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.937819  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0602  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  27.5 
 
 
330 aa  45.4  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.171113  normal  0.0295962 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0583  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  27.08 
 
 
320 aa  45.4  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0238  bacteriochlorophyll c synthase  26.97 
 
 
334 aa  45.1  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.325704  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1105  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  24.35 
 
 
299 aa  43.9  0.003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.359039  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1605  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  26.34 
 
 
325 aa  44.3  0.003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.316081 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1142  UbiA prenyltransferase  26.23 
 
 
267 aa  42.4  0.008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0627  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  28.42 
 
 
303 aa  42.4  0.008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.916979  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1742  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  28.57 
 
 
276 aa  42.4  0.01  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>