16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_1688 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009486  Tpet_1688  hypothetical protein  100 
 
 
407 aa  845    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.643287  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1907  hypothetical protein  26.85 
 
 
420 aa  132  7.999999999999999e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0402  hypothetical protein  26.51 
 
 
442 aa  84  0.000000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000122987  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1804  hypothetical protein  25 
 
 
447 aa  80.9  0.00000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.038928 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2186  hypothetical protein  24.65 
 
 
444 aa  79  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.131537  normal  0.0421946 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4089  hypothetical protein  23.21 
 
 
468 aa  78.6  0.0000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3064  hypothetical protein  24.21 
 
 
493 aa  77.4  0.0000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00098434 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1804  hypothetical protein  23.02 
 
 
467 aa  75.1  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000611793  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2666  hypothetical protein  23.04 
 
 
441 aa  73.6  0.000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2786  hypothetical protein  23.42 
 
 
473 aa  70.9  0.00000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.300961  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1335  hypothetical protein  23.8 
 
 
455 aa  67.4  0.0000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1057  hypothetical protein  25.3 
 
 
414 aa  66.6  0.0000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0341619  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2135  hypothetical protein  22.35 
 
 
503 aa  64.7  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.83989 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6336  hypothetical protein  21.72 
 
 
462 aa  57  0.0000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.515423  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0206  hypothetical protein  23.15 
 
 
483 aa  50.1  0.00007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.744086  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3386  hypothetical protein  22.75 
 
 
440 aa  48.5  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>