27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_R0042 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_R0042  tRNA-Gln  100 
 
 		 72 bp  143  6e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0024  tRNA-Gln  98.25 
 
 		 75 bp  105  1e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0044  tRNA-Gln  91.8 
 
 		 75 bp  81.8  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0920336  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0041  tRNA-Gln  91.8 
 
 		 75 bp  81.8  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.646474  normal  0.266593 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0046  tRNA-Gln  91.8 
 
 		 72 bp  81.8  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.756358 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0041  tRNA-Gln  91.8 
 
 		 75 bp  81.8  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0020  tRNA-Gln  91.8 
 
 		 72 bp  81.8  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.729008 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14016  tRNA-Gln  91.8 
 
 		 72 bp  81.8  0.00000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0439144  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32340  tRNA-Gln  90.48 
 
 		 72 bp  77.8  0.0000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.301649 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0051  tRNA-Gln  89.47 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.321747  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0037  tRNA-Gln  89.47 
 
 		 72 bp  65.9  0.000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.461495  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14036  tRNA-Gln  89.47 
 
 		 72 bp  65.9  0.000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000697589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0012  tRNA-Gln  89.47 
 
 		 72 bp  65.9  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.363597 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0016  tRNA-Gln  89.47 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0012  tRNA-Gln  89.47 
 
 		 72 bp  65.9  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0013  tRNA-Gln  89.47 
 
 		 72 bp  65.9  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.428815  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13370  tRNA-Gln  89.29 
 
 		 72 bp  63.9  0.000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0908228  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_t0036  tRNA-Gln  87.27 
 
 		 75 bp  54  0.000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.868665  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0066  tRNA-Gln  85.96 
 
 		 72 bp  50.1  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0047  tRNA-Gln  85.96 
 
 		 72 bp  50.1  0.00007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.220381  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0006  tRNA-Gln  85.96 
 
 		 72 bp  50.1  0.00007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11070  tRNA-Gln  85.96 
 
 		 72 bp  50.1  0.00007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0015  tRNA-Gln  85.96 
 
 		 72 bp  50.1  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_tGln01  tRNA-Gln  91.67 
 
 		 79 bp  48.1  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.794432  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0058  tRNA-Gln  85.45 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0207136  hitchhiker  0.00175825 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_t36  tRNA-Lys  100 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0053  tRNA-Gln  89.47 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>