12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_4024 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_4024  hypothetical protein  100 
 
 		 187 aa  372  1e-102  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5077  hypothetical protein  35.14 
 
 		 168 aa  52.8  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0984247  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3101  hypothetical protein  30 
 
 		 169 aa  51.6  0.000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.148369  normal  0.0228656 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5049  hypothetical protein  41.18 
 
 		 163 aa  48.5  0.00005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5137  hypothetical protein  41.18 
 
 		 163 aa  48.5  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5428  hypothetical protein  42.42 
 
 		 163 aa  48.5  0.00005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1549  hypothetical protein  35.71 
 
 		 194 aa  48.5  0.00005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0808591  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1131  hypothetical protein  39.71 
 
 		 163 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00302689  normal  0.703813 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5675  hypothetical protein  36.9 
 
 		 163 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.61396  decreased coverage  0.000970762 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4703  hypothetical protein  33.33 
 
 		 168 aa  45.1  0.0005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0124469 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1057  hypothetical protein  31.25 
 
 		 171 aa  44.7  0.0009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.424497  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0152  hypothetical protein  29.09 
 
 		 170 aa  42.4  0.004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.510042  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>