18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_3946 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_3946  hypothetical protein  100 
 
 		 68 aa  134  5e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11171  hypothetical protein  64.52 
 
 		 216 aa  84.7  4e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2133  methyltransferase type 12  61.29 
 
 		 210 aa  78.6  0.00000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.153525  normal  0.347515 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4571  methyltransferase type 12  62.9 
 
 		 209 aa  78.2  0.00000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.156047 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4063  methyltransferase type 12  55.93 
 
 		 210 aa  70.5  0.000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4138  methyltransferase type 12  55.93 
 
 		 210 aa  70.5  0.000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.950968 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4292  methyltransferase type 12  57.63 
 
 		 210 aa  70.5  0.000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.401228  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2621  Methyltransferase type 11  56.67 
 
 		 219 aa  64.7  0.0000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4481  methyltransferase type 11  50 
 
 		 213 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.980043  normal  0.396448 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1826  Methyltransferase type 11  58.14 
 
 		 201 aa  51.6  0.000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00341289  normal  0.127097 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1427  Methyltransferase type 11  48.33 
 
 		 220 aa  50.4  0.000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00176149  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2692  methyltransferase type 11  50 
 
 		 206 aa  45.8  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.253841 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1591  Methyltransferase type 11  43.28 
 
 		 229 aa  45.8  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3273  hypothetical protein  58.82 
 
 		 133 aa  43.5  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000980907  hitchhiker  0.000172386 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2834  Methyltransferase type 11  41.86 
 
 		 203 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0713675 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1091  Methyltransferase type 11  36.84 
 
 		 206 aa  42.7  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.192231  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0008  phosphatidyl-N-methylethanolamine N-methyltransferase / phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  32.84 
 
 		 199 aa  41.6  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.257422  normal  0.214675 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2605  UbiE/COQ5 methyltransferase  41.86 
 
 		 206 aa  40.8  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0775549  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>