17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_3753 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_3753  hypothetical protein  100 
 
 		 445 aa  893    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.18885  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4394  hypothetical protein  38.76 
 
 		 482 aa  255  1.0000000000000001e-66  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0532  hypothetical protein  36.93 
 
 		 439 aa  189  9e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0200  hypothetical protein  33.89 
 
 		 439 aa  186  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.749346  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0542  hypothetical protein  36.93 
 
 		 439 aa  184  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0482134  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0554  hypothetical protein  36.93 
 
 		 439 aa  184  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.656823  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3507  hypothetical protein  35.94 
 
 		 419 aa  179  8e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0705  hypothetical protein  34.38 
 
 		 439 aa  172  7.999999999999999e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0579407 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10417  hypothetical protein  33.81 
 
 		 439 aa  171  2e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000130762  normal  0.910848 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37220  hypothetical protein  31.75 
 
 		 469 aa  159  9e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.121364 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4552  hypothetical protein  29.14 
 
 		 454 aa  133  7.999999999999999e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.296569  normal  0.420738 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3061  hypothetical protein  29.02 
 
 		 433 aa  100  6e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000314262 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4940  putative secreted protein  30.51 
 
 		 463 aa  93.2  9e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2814  hypothetical protein  29.15 
 
 		 558 aa  88.2  3e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.856062  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2158  secreted protein  30.37 
 
 		 477 aa  74.7  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2422  putative secreted protein  34.05 
 
 		 428 aa  72.8  0.00000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0376537  normal  0.0559574 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2458  hypothetical protein  30.56 
 
 		 519 aa  53.9  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00115564  normal  0.62035 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>