16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_2840 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_2840  hypothetical protein  100 
 
 
192 aa  385  1e-106  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3208  hypothetical protein  37.23 
 
 
209 aa  99  4e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12995  hypothetical protein  39.1 
 
 
181 aa  92.8  2e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00625198  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1976  hypothetical protein  34.51 
 
 
177 aa  74.7  0.0000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.524667  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1910  hypothetical protein  34.51 
 
 
177 aa  74.7  0.0000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1930  hypothetical protein  34.51 
 
 
195 aa  74.7  0.0000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.900616  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09170  hypothetical protein  37.23 
 
 
185 aa  73.6  0.000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.73086 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4218  hypothetical protein  35.62 
 
 
200 aa  71.2  0.000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.19108  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2149  hypothetical protein  31.65 
 
 
207 aa  67.4  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5987  hypothetical protein  33.33 
 
 
180 aa  67.4  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0202  hypothetical protein  40.34 
 
 
155 aa  64.7  0.0000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1486  hypothetical protein  34.43 
 
 
191 aa  58.9  0.00000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0685167  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4042  hypothetical protein  33.86 
 
 
180 aa  50.1  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.119824  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2791  hypothetical protein  34.85 
 
 
145 aa  42.7  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.688451  normal  0.192686 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3445  hypothetical protein  31.43 
 
 
141 aa  42  0.006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.815991  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0641  hypothetical protein  35.79 
 
 
156 aa  41.2  0.008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>