25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_2115 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_2115  monooxygenase  100 
 
 
435 aa  868    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.827363  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4329  hypothetical protein  52.01 
 
 
463 aa  423  1e-117  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6219  putative oxidoreductase  34.17 
 
 
461 aa  219  7.999999999999999e-56  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0853  putative oxygenase subunit protein  31.47 
 
 
417 aa  149  1.0000000000000001e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5734  hypothetical protein  29.57 
 
 
413 aa  118  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.422452  normal  0.261408 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5474  putative oxygenase subunit protein  27.02 
 
 
408 aa  115  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.72272 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3469  putative oxygenase subunit protein  27.2 
 
 
429 aa  114  4.0000000000000004e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0690233  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3319  putative oxygenase subunit protein  27.59 
 
 
413 aa  114  4.0000000000000004e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0147948  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3428  putative dehydrogenase/oxygenase subunit (flavoprotein)  27.46 
 
 
412 aa  110  5e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.251863  normal  0.249872 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2850  putative oxygenase subunit protein  30.6 
 
 
421 aa  107  4e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2912  putative oxygenase subunit protein  29.66 
 
 
415 aa  104  3e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.69464 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6773  hypothetical protein  25.93 
 
 
412 aa  102  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.903776  normal  0.672585 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5487  hypothetical protein  25.93 
 
 
412 aa  102  1e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.544992  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6307  hypothetical protein  25.19 
 
 
412 aa  101  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.398194 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7179  hypothetical protein  25.93 
 
 
412 aa  101  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.055566 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6361  hypothetical protein  25.93 
 
 
412 aa  100  4e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6011  hypothetical protein  24.77 
 
 
412 aa  100  6e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.652248 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1837  putative oxygenase subunit protein  26.18 
 
 
416 aa  100  8e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.272624  normal  0.145679 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1791  putative dehydrogenase/oxygenase subunit (flavoprotein)  27.46 
 
 
431 aa  95.5  2e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.480723  normal  0.833555 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1344  putative oxygenase  25.06 
 
 
413 aa  92.4  1e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00629654  hitchhiker  0.0000135484 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33980  oxygenase subunit protein  28 
 
 
405 aa  79.3  0.0000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4435  putative monooxygenase  25.87 
 
 
415 aa  78.2  0.0000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.975242  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4509  FAD dependent oxidoreductase  25.34 
 
 
416 aa  73.6  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.014564  normal  0.247728 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0493  putative oxygenase subunit protein  25.41 
 
 
418 aa  72  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2578  UbiH/UbiF/VisC/COQ6 family ubiquinone biosynthesis hydroxylase  32.97 
 
 
381 aa  45.4  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>