25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_0628 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_0628  Protein of unknown function DUF2596  100 
 
 
170 aa  345  2e-94  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0990  Protein of unknown function DUF2596  62.65 
 
 
196 aa  208  3e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0281442  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0085  hypothetical protein  58.64 
 
 
169 aa  202  3e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0658  hypothetical protein  61.69 
 
 
177 aa  199  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.524991  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0671  hypothetical protein  61.69 
 
 
177 aa  199  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.758778  normal  0.578699 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0828  hypothetical protein  57.76 
 
 
176 aa  199  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.193703  normal  0.916885 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0651  hypothetical protein  61.69 
 
 
177 aa  199  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.334419 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6756  hypothetical protein  67.16 
 
 
165 aa  182  2.0000000000000003e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02660  Protein of unknown function (DUF2596)  63.57 
 
 
181 aa  179  1e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.249283  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10495  hypothetical protein  57.96 
 
 
183 aa  168  3e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000885199  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4608  Protein of unknown function DUF2596  60.94 
 
 
177 aa  160  1e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4934  hypothetical protein  47.2 
 
 
159 aa  157  6e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4049  hypothetical protein  57.58 
 
 
199 aa  155  3e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0696  hypothetical protein  48.73 
 
 
161 aa  152  2.9999999999999998e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5954  hypothetical protein  52.23 
 
 
159 aa  146  1.0000000000000001e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8223  hypothetical protein  47.13 
 
 
182 aa  146  1.0000000000000001e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2912  hypothetical protein  47.24 
 
 
173 aa  146  1.0000000000000001e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0332  hypothetical protein  47.44 
 
 
190 aa  143  1e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03660  Protein of unknown function (DUF2596)  43.83 
 
 
201 aa  132  3e-30  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.861967  normal  0.289484 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0957  hypothetical protein  44.81 
 
 
159 aa  129  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.46128  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0495  hypothetical protein  45.45 
 
 
173 aa  127  7.000000000000001e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.620589  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4337  Protein of unknown function DUF2596  43.33 
 
 
179 aa  125  3e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0399  hypothetical protein  48.08 
 
 
184 aa  120  8e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0366616  hitchhiker  0.00240143 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0455  hypothetical protein  47.06 
 
 
164 aa  107  1e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.576485 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6163  hypothetical protein  47.06 
 
 
164 aa  104  7e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.160628 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>