26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_0142 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_0142  hypothetical protein  100 
 
 
245 aa  481  1e-135  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1144  hypothetical protein  42.97 
 
 
262 aa  185  4e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0437754  normal  0.0600359 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5663  hypothetical protein  42.59 
 
 
266 aa  183  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.570228  normal  0.031893 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5035  hypothetical protein  40.8 
 
 
273 aa  176  2e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.478357  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5123  hypothetical protein  40.8 
 
 
273 aa  176  2e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5416  hypothetical protein  40.8 
 
 
273 aa  177  2e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.720653 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0174  hypothetical protein  50.81 
 
 
263 aa  163  3e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.217261  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13873  hypothetical protein  37.35 
 
 
258 aa  161  9e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0086  hypothetical protein  38.52 
 
 
252 aa  134  9.999999999999999e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01020  hypothetical protein  37.9 
 
 
265 aa  131  1.0000000000000001e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.551056  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5476  hypothetical protein  37.23 
 
 
254 aa  102  6e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2657  hypothetical protein  37.14 
 
 
244 aa  92.4  6e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00775221  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4368  hypothetical protein  30.88 
 
 
239 aa  63.9  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0175  hypothetical protein  28.21 
 
 
250 aa  63.5  0.000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0933557  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4367  hypothetical protein  38.28 
 
 
304 aa  56.2  0.0000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4816  hypothetical protein  37.5 
 
 
304 aa  54.3  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.536398 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1109  hypothetical protein  27.45 
 
 
327 aa  51.2  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.182239  normal  0.383462 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4935  hypothetical protein  30.77 
 
 
245 aa  50.8  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.791383 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1085  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  33.33 
 
 
276 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.429706  normal  0.50341 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3405  hypothetical protein  31.37 
 
 
247 aa  47.4  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.214353  normal  0.0597402 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5502  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  34.83 
 
 
266 aa  47  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5737  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  32.1 
 
 
270 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.602445 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5211  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  34.83 
 
 
266 aa  47  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.733021  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5122  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding protein  34.83 
 
 
266 aa  47  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3402  hypothetical protein  30.12 
 
 
242 aa  47  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0197129  normal  0.301913 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4817  hypothetical protein  29.75 
 
 
239 aa  44.7  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>